Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G093550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RD19
Pfam PF00098
Panther DB PTHR23002 PTHR23002:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45890.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G322101 - -
2 Sobic.004G234766 - -
3 Sobic.002G397700 - -
4 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
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9 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
10 Sobic.003G255850 - -
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12 Sobic.003G172450 - -
13 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
15 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G096500 - -
17 Sobic.005G167100 - -
18 Sobic.010G225400 expressed protein -
19 Sobic.010G107601 - -
20 Sobic.006G017266 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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