Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G139200.1
Synonym
Functional annotation zinc knuckle family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RDU5
Pfam -
Panther DB PTHR33075 PTHR33075:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g28300.1 : zinc knuckle family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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2 Sobic.003G172450 - -
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20 Sobic.010G133225 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic006G139200--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic006G139200--Sobic003G172450 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic006G139200--Sobic002G390200 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic006G139200--Sobic002G180732 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic009G087480 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic006G139200--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic006G139200--Sobic002G397700 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic006G139200--Sobic003G160300 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic006G139200--Sobic004G234766 Sobic002G040550--Sobic006G139200 Sobic002G040550--Sobic003G172450 Sobic002G040550--Sobic002G390200 Sobic002G040550--Sobic002G180732 Sobic002G040550--Sobic009G087480 Sobic002G040550--Sobic010G107901 Sobic002G040550--Sobic002G397700 Sobic002G040550--Sobic003G160300 Sobic002G040550--Sobic004G234766 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic003G172450 Sobic002G180732--Sobic002G390200 Sobic002G180732--Sobic003G160433 Sobic002G180732--Sobic003G160300 Sobic002G180732--Sobic006G139200 Sobic002G180732--Sobic002G040550 Sobic002G180732--Sobic003G172450 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic002G180732--Sobic001G128000 Sobic002G180732--Sobic007G085900 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic002G180732--Sobic005G199151 Sobic009G087480--Sobic006G139200 Sobic009G087480--Sobic002G040550 Sobic009G087480--Sobic002G180732 Sobic009G087480--Sobic002G390200 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic009G087480--Sobic005G187800 Sobic009G087480--Sobic003G172450 Sobic009G087480--Sobic005G199151 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic009G087480--Sobic001G259850 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic009G087480--Sobic004G351000 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic010G107901 Sobic002G397700--Sobic004G234766 Sobic002G397700--Sobic006G093550 Sobic002G397700--Sobic003G172450 Sobic002G397700--Sobic002G322101 Sobic002G397700--Sobic010G133225 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic003G337200 Sobic003G160300--Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic002G390200 Sobic003G160300--Sobic007G085900 Sobic003G160300--Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic008G140050 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic001G128000 Sobic003G160300--Sobic002G180732 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160300--Sobic001G054050 Sobic004G234766--Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic002G397700 Sobic004G234766--Sobic006G093550 Sobic004G234766--Sobic002G322101 Sobic004G234766--Sobic003G172450 Sobic004G234766--Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic010G133225 Sobic004G234766--Sobic003G337200
Octagon: transcription factors


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