Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G199151.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJG5
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF139
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42240.1 : OsFBX431 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G351000 - -
2 Sobic.002G180732 - -
3 Sobic.008G029000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY40, expressed -
4 Sobic.002G232300 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
5 Sobic.010G018200 expressed protein -
6 Sobic.005G187800 - -
7 Sobic.009G087480 - -
8 Sobic.001G259850 - -
9 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.003G160433 - -
11 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
12 Sobic.002G040550 - -
13 Sobic.003G160300 - -
14 Sobic.003G081200 expressed protein -
15 Sobic.003G003300 expressed protein -
16 Sobic.009G147450 - -
17 Sobic.010G193100 expressed protein -
18 Sobic.001G343700 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
20 Sobic.004G157050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic005G199151--Sobic004G351000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic005G199151--Sobic002G180732 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic005G199151--Sobic008G029000 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic005G199151--Sobic002G232300 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic005G199151--Sobic010G018200 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic005G199151--Sobic005G187800 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic005G199151--Sobic009G087480 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic005G199151--Sobic001G259850 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic005G199151--Sobic002G390200 Sobic004G351000--Sobic005G199151 Sobic004G351000--Sobic002G232300 Sobic004G351000--Sobic008G029000 Sobic004G351000--Sobic001G259850 Sobic004G351000--Sobic010G018200 Sobic004G351000--Sobic002G180732 Sobic004G351000--Sobic005G187800 Sobic001G343700 Sobic001G343700 Sobic004G351000--Sobic001G343700 Sobic004G351000--Sobic009G087480 Sobic002G180732--Sobic002G390200 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic002G180732--Sobic003G160433 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic002G180732--Sobic003G160300 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G180732--Sobic006G139200 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G180732--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G180732--Sobic003G172450 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic002G180732--Sobic001G128000 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic002G180732--Sobic007G085900 Sobic002G180732--Sobic005G199151 Sobic008G029000--Sobic010G018200 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic008G029000--Sobic003G003300 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic008G029000--Sobic006G202900 Sobic008G029000--Sobic005G187800 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic008G029000--Sobic008G007500 Sobic008G029000--Sobic001G259850 Sobic008G029000--Sobic004G351000 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic008G029000--Sobic010G193100 Sobic008G029000--Sobic005G199151 Sobic002G232300--Sobic004G351000 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic002G232300--Sobic004G230000 Sobic010G018200--Sobic008G029000 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G018200--Sobic005G065050 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic010G018200--Sobic009G147450 Sobic010G018200--Sobic003G003300 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic010G018200--Sobic004G024350 Sobic010G018200--Sobic004G230000 Sobic005G187800--Sobic008G007500 Sobic005G187800--Sobic008G029000 Sobic005G187800--Sobic009G087480 Sobic005G187800--Sobic002G232300 Sobic005G187800--Sobic006G139200 Sobic010G278900 Sobic010G278900 Sobic005G187800--Sobic010G278900 Sobic005G187800--Sobic004G351000 Sobic005G187800--Sobic005G199151 Sobic005G187800--Sobic010G018200 Sobic009G087480--Sobic006G139200 Sobic009G087480--Sobic002G040550 Sobic009G087480--Sobic002G180732 Sobic009G087480--Sobic002G390200 Sobic009G087480--Sobic005G187800 Sobic009G087480--Sobic003G172450 Sobic009G087480--Sobic005G199151 Sobic009G087480--Sobic001G259850 Sobic009G087480--Sobic004G351000 Sobic001G259850--Sobic008G029000 Sobic001G259850--Sobic004G351000 Sobic001G259850--Sobic003G003300 Sobic001G259850--Sobic004G230000 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic003G172450
Octagon: transcription factors


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