Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G193100.1
Synonym Sb10g024270
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z646
Pfam -
Panther DB PTHR34483:SF3 PTHR34483
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G18690 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g04339.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051536
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G006030.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G029000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY40, expressed -
2 Sobic.002G190600 - -
3 Sobic.006G202900 expressed protein -
4 Sobic.010G018200 expressed protein -
5 Sobic.008G007500 HIT zinc finger domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G091900 - -
7 Sobic.003G192500 - -
8 Sobic.005G065050 - -
9 Sobic.005G119250 - -
10 Sobic.003G003300 expressed protein -
11 Sobic.002G087700 - -
12 Sobic.001G423666 - -
13 Sobic.009G147450 - -
14 Sobic.005G187800 - -
15 Sobic.001G505066 - -
16 Sobic.009G152800 transporter family protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G199151 - -
18 Sobic.004G351000 - -
19 Sobic.007G202360 - -
20 Sobic.004G353650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic010G193100--Sobic008G029000 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G193100--Sobic002G190600 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic010G193100--Sobic006G202900 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic010G018200 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic010G193100--Sobic008G007500 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic010G193100--Sobic004G091900 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G193100--Sobic003G192500 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G193100--Sobic005G065050 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic010G193100--Sobic005G119250 Sobic008G029000--Sobic010G018200 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic008G029000--Sobic003G003300 Sobic008G029000--Sobic006G202900 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic008G029000--Sobic005G187800 Sobic008G029000--Sobic008G007500 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic008G029000--Sobic001G259850 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic008G029000--Sobic004G351000 Sobic008G029000--Sobic010G193100 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic008G029000--Sobic005G199151 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G190600--Sobic001G423666 Sobic006G202900--Sobic008G029000 Sobic006G202900--Sobic002G190600 Sobic006G202900--Sobic008G007500 Sobic006G202900--Sobic003G003300 Sobic006G202900--Sobic005G065050 Sobic006G202900--Sobic010G018200 Sobic006G202900--Sobic010G193100 Sobic006G202900--Sobic003G192500 Sobic006G202900--Sobic005G119250 Sobic010G018200--Sobic008G029000 Sobic010G018200--Sobic005G065050 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic010G018200--Sobic009G147450 Sobic010G018200--Sobic003G003300 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic010G018200--Sobic004G024350 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic010G018200--Sobic004G230000 Sobic008G007500--Sobic005G187800 Sobic008G007500--Sobic008G029000 Sobic008G007500--Sobic004G091900 Sobic008G007500--Sobic006G202900 Sobic008G007500--Sobic002G190600 Sobic008G007500--Sobic010G018200 Sobic008G007500--Sobic010G193100 Sobic008G007500--Sobic003G003300 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic008G007500--Sobic002G087700 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G091900--Sobic003G064901 Sobic004G091900--Sobic008G007500 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G091900--Sobic003G330350 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic004G091900--Sobic001G270800 Sobic004G091900--Sobic002G087700 Sobic010G065001 Sobic010G065001 Sobic004G091900--Sobic010G065001 Sobic004G091900--Sobic010G193100 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic004G091900--Sobic001G098700 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic004G091900--Sobic001G011600 Sobic003G192500--Sobic002G190600 Sobic003G192500--Sobic007G202360 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic004G301250 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic003G192500--Sobic010G120900 Sobic003G192500--Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic001G505066 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic006G202900 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G192500--Sobic004G073232 Sobic005G065050--Sobic009G147450 Sobic005G065050--Sobic010G018200 Sobic005G065050--Sobic002G190600 Sobic005G065050--Sobic001G505066 Sobic005G065050--Sobic001G423666 Sobic005G065050--Sobic007G202360 Sobic005G065050--Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic006G202900 Sobic005G065050--Sobic008G029000 Sobic005G119250--Sobic002G190600 Sobic005G119250--Sobic003G192500 Sobic005G119250--Sobic006G202900 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic005G119250--Sobic008G122250 Sobic005G119250--Sobic005G065050 Sobic005G119250--Sobic010G193100 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic005G119250--Sobic001G020350 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic008G029000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.