Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G152800.1
Synonym
Functional annotation transporter family protein, putative, expressed
UniProt C5YYP0
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF83
NCBI CDD KOG0254; Predicted transporter (major facilitator superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G61520 : Major facilitator superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g09520.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011155 , Zm00025a028431 , Zm00025a015345
Brachypodium KQJ95161 , KQK17831 , KQJ99960 , KQK00003
Barley HORVU7Hr1G019280.4 , HORVU7Hr1G019280.1 , HORVU7Hr1G019280.3 , HORVU7Hr1G019280.2 , HORVU1Hr1G013480.5 , HORVU1Hr1G013480.4 , HORVU1Hr1G013480.3 , HORVU1Hr1G013480.2 , HORVU1Hr1G013480.1 , HORVU7Hr1G019240.1 , HORVU5Hr1G054140.5 , HORVU5Hr1G054140.4 , HORVU5Hr1G054140.3 , HORVU5Hr1G054140.2 , HORVU5Hr1G054140.1
Wheat TraesCS5A02G001100 , TraesCS5D02G001600 , TraesCS5B02G001000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G152800 Sobic009G152800 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic009G152800--Sobic002G190600 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic009G152800--Sobic001G505066 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic009G152800--Sobic010G193100 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic009G152800--Sobic003G192500 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic009G152800--Sobic002G087700 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic009G152800--Sobic005G065050 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic009G152800--Sobic005G119250 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic009G152800--Sobic009G147450 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic009G152800--Sobic010G172633 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G190600--Sobic001G423666 Sobic001G505066--Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic007G202360 Sobic001G505066--Sobic002G190600 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic009G147450 Sobic001G505066--Sobic010G172633 Sobic001G505066--Sobic003G192500 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G035700 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic001G505066--Sobic001G488800 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic010G193100--Sobic008G029000 Sobic010G193100--Sobic002G190600 Sobic010G193100--Sobic006G202900 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic010G018200 Sobic010G193100--Sobic008G007500 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic010G193100--Sobic004G091900 Sobic010G193100--Sobic003G192500 Sobic010G193100--Sobic005G065050 Sobic010G193100--Sobic005G119250 Sobic003G192500--Sobic002G190600 Sobic003G192500--Sobic007G202360 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic004G301250 Sobic003G192500--Sobic010G120900 Sobic003G192500--Sobic002G087700 Sobic003G192500--Sobic001G505066 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic003G123900 Sobic003G192500--Sobic006G202900 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G192500--Sobic004G073232 Sobic002G087700--Sobic003G192500 Sobic002G087700--Sobic004G091900 Sobic002G087700--Sobic002G190600 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic002G087700--Sobic003G064901 Sobic002G087700--Sobic008G007500 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic002G087700--Sobic008G040501 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic002G087700--Sobic009G102250 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G087700--Sobic002G380550 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic002G087700--Sobic004G032200 Sobic005G065050--Sobic009G147450 Sobic005G065050--Sobic010G018200 Sobic005G065050--Sobic002G190600 Sobic005G065050--Sobic001G505066 Sobic005G065050--Sobic001G423666 Sobic005G065050--Sobic007G202360 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic006G202900 Sobic005G065050--Sobic008G029000 Sobic005G119250--Sobic002G190600 Sobic005G119250--Sobic003G192500 Sobic005G119250--Sobic006G202900 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic005G119250--Sobic008G122250 Sobic005G119250--Sobic005G065050 Sobic005G119250--Sobic010G193100 Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic005G119250--Sobic001G020350 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic008G029000 Sobic009G147450--Sobic005G065050 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic009G147450--Sobic003G081200 Sobic009G147450--Sobic010G018200 Sobic009G147450--Sobic004G024350 Sobic009G147450--Sobic001G423666 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic009G147450--Sobic004G230000 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G315300 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G035700 Sobic010G172633--Sobic001G505066 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic009G147450 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic010G172633--Sobic003G147800 Sobic003G132200 Sobic003G132200 Sobic010G172633--Sobic003G132200 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G172633--Sobic002G109900
Octagon: transcription factors


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