Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G035700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QH85
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G172633 - -
2 Sobic.009G124100 - -
3 Sobic.001G505066 - -
4 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
5 Sobic.004G104250 - -
6 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
7 Sobic.010G081950 - -
8 Sobic.001G184950 - -
9 Sobic.001G143850 - -
10 Sobic.009G147450 - -
11 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
12 Sobic.005G065050 - -
13 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G292000 - -
15 Sobic.003G081200 expressed protein -
16 Sobic.006G089350 - -
17 Sobic.002G395400 - -
18 Sobic.002G204700 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.008G012200 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, putative, expressed K03013: RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
20 Sobic.005G224601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G035700--Sobic010G172633 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic001G035700--Sobic009G124100 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic001G035700--Sobic001G505066 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic001G035700--Sobic001G488800 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G035700--Sobic004G104250 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic001G035700--Sobic002G310400 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic001G035700--Sobic010G081950 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic001G035700--Sobic001G184950 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic001G035700--Sobic001G143850 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G035700 Sobic010G172633--Sobic001G505066 Sobic010G172633--Sobic001G184950 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic010G172633--Sobic009G147450 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic010G172633--Sobic003G147800 Sobic003G132200 Sobic003G132200 Sobic010G172633--Sobic003G132200 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G172633--Sobic002G109900 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic001G505066--Sobic005G065050 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic001G505066--Sobic007G202360 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic001G505066--Sobic002G190600 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic010G120900 Sobic001G505066--Sobic009G147450 Sobic001G505066--Sobic010G172633 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic001G505066--Sobic003G192500 Sobic001G505066--Sobic001G035700 Sobic001G505066--Sobic001G488800 Sobic001G488800--Sobic001G505066 Sobic001G488800--Sobic009G124100 Sobic001G488800--Sobic001G035700 Sobic001G488800--Sobic002G310400 Sobic001G488800--Sobic004G104250 Sobic001G488800--Sobic005G065050 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic001G488800--Sobic010G018200 Sobic001G488800--Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic009G147450 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic002G310400--Sobic004G104250 Sobic002G310400--Sobic010G081950 Sobic001G331401 Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic009G124100 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic001G488800 Sobic002G310400--Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic005G065050 Sobic010G081950--Sobic004G104250 Sobic010G081950--Sobic009G124100 Sobic010G081950--Sobic002G310400 Sobic010G081950--Sobic006G089350 Sobic010G081950--Sobic005G224601 Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic006G210233 Sobic010G081950--Sobic001G035700 Sobic010G081950--Sobic001G488800 Sobic001G184950--Sobic010G172633 Sobic001G184950--Sobic001G315300 Sobic001G184950--Sobic001G035700 Sobic001G184950--Sobic002G109900 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic001G184950--Sobic003G081200 Sobic001G060800 Sobic001G060800 Sobic001G184950--Sobic001G060800 Sobic001G184950--Sobic001G143850 Sobic004G039800 Sobic004G039800 Sobic001G184950--Sobic004G039800 Sobic001G184950--Sobic009G147450 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500
Octagon: transcription factors


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