Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G089350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDH3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G210233 - -
2 Sobic.005G165950 - -
3 Sobic.004G104250 - -
4 Sobic.009G124100 - -
5 Sobic.005G224601 - -
6 Sobic.010G081950 - -
7 Sobic.002G310400 chalcone synthase, putative, expressed -
8 Sobic.008G179400 expressed protein -
9 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
10 Sobic.001G035700 - -
11 Sobic.001G505033 - -
12 Sobic.001G324000 OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G238400 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G438000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G175800 chalcone synthase, putative, expressed -
16 Sobic.002G191900 OsFBX325 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G171600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.002G395400 - -
19 Sobic.005G076200 rp3 protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G271100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic006G089350--Sobic006G210233 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic006G089350--Sobic005G165950 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic006G089350--Sobic004G104250 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic006G089350--Sobic009G124100 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic006G089350--Sobic005G224601 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic006G089350--Sobic010G081950 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic006G089350--Sobic002G310400 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic006G089350--Sobic008G179400 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic006G089350--Sobic001G488800 Sobic006G210233--Sobic005G224601 Sobic006G210233--Sobic005G165950 Sobic006G210233--Sobic006G089350 Sobic006G210233--Sobic008G179400 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic001G505033 Sobic006G210233--Sobic004G104250 Sobic006G210233--Sobic009G124100 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic001G324000 Sobic006G210233--Sobic010G081950 Sobic005G165950--Sobic006G210233 Sobic005G165950--Sobic005G224601 Sobic005G165950--Sobic006G089350 Sobic005G165950--Sobic008G179400 Sobic005G165950--Sobic001G505033 Sobic005G165950--Sobic009G124100 Sobic005G165950--Sobic004G104250 Sobic005G165950--Sobic001G324000 Sobic005G165950--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic009G124100 Sobic004G104250--Sobic010G081950 Sobic004G104250--Sobic002G310400 Sobic004G104250--Sobic006G089350 Sobic004G104250--Sobic005G224601 Sobic004G104250--Sobic006G210233 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G035700 Sobic004G104250--Sobic001G488800 Sobic004G104250--Sobic005G165950 Sobic009G124100--Sobic004G104250 Sobic009G124100--Sobic010G081950 Sobic009G124100--Sobic001G035700 Sobic009G124100--Sobic002G310400 Sobic009G124100--Sobic006G089350 Sobic009G124100--Sobic005G224601 Sobic009G124100--Sobic006G210233 Sobic009G124100--Sobic001G488800 Sobic009G124100--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic006G210233 Sobic005G224601--Sobic005G165950 Sobic005G224601--Sobic008G179400 Sobic005G224601--Sobic004G104250 Sobic005G224601--Sobic009G124100 Sobic005G224601--Sobic006G089350 Sobic005G224601--Sobic001G505033 Sobic005G224601--Sobic001G324000 Sobic005G224601--Sobic010G081950 Sobic010G081950--Sobic004G104250 Sobic010G081950--Sobic009G124100 Sobic010G081950--Sobic002G310400 Sobic010G081950--Sobic006G089350 Sobic010G081950--Sobic005G224601 Sobic004G238400 Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic004G238400 Sobic010G081950--Sobic006G210233 Sobic010G081950--Sobic001G035700 Sobic010G081950--Sobic001G488800 Sobic002G310400--Sobic004G104250 Sobic002G310400--Sobic010G081950 Sobic001G331401 Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic001G331401 Sobic002G310400--Sobic009G124100 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic002G310400--Sobic004G024350 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic009G147450 Sobic002G310400--Sobic001G488800 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic002G310400--Sobic010G018200 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic002G310400--Sobic005G065050 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic001G505033 Sobic008G179400--Sobic006G210233 Sobic008G179400--Sobic005G224601 Sobic008G179400--Sobic005G165950 Sobic008G179400--Sobic001G324000 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic002G395400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic003G094900 Sobic008G179400--Sobic006G089350 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic001G488800--Sobic001G505066 Sobic001G488800--Sobic009G124100 Sobic001G488800--Sobic001G035700 Sobic001G488800--Sobic002G310400 Sobic001G488800--Sobic004G104250 Sobic001G488800--Sobic005G065050 Sobic001G488800--Sobic010G018200 Sobic001G488800--Sobic010G081950 Sobic001G488800--Sobic009G147450
Octagon: transcription factors


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