Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G395400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QFV4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G394150 - -
2 Sobic.004G175800 chalcone synthase, putative, expressed -
3 Sobic.003G257650 - -
4 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
5 Sobic.008G179400 expressed protein -
6 Sobic.003G094900 tRNAHis guanylyltransferase family protein, expressed -
7 Sobic.007G043750 - -
8 Sobic.002G204700 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.004G224733 - -
10 Sobic.008G012200 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, putative, expressed K03013: RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
11 Sobic.003G432400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G327950 - -
13 Sobic.005G224601 - -
14 Sobic.001G035700 - -
15 Sobic.010G203400 - -
16 Sobic.006G210233 - -
17 Sobic.001G397550 - -
18 Sobic.001G143850 - -
19 Sobic.001G308350 - -
20 Sobic.005G078600 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic002G395400--Sobic003G394150 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic002G395400--Sobic004G175800 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic002G395400--Sobic003G257650 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic002G395400--Sobic010G020000 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic002G395400--Sobic008G179400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic002G395400--Sobic003G094900 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic002G395400--Sobic007G043750 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic002G395400--Sobic002G204700 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic002G395400--Sobic004G224733 Sobic003G394150--Sobic002G395400 Sobic003G394150--Sobic010G020000 Sobic003G394150--Sobic003G257650 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic003G394150--Sobic009G053700 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic002G204700 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic007G043750 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G394150--Sobic002G367000 Sobic004G175800--Sobic008G179400 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic004G175800--Sobic001G505033 Sobic004G175800--Sobic002G395400 Sobic004G175800--Sobic007G043750 Sobic005G224601 Sobic005G224601 Sobic004G175800--Sobic005G224601 Sobic006G210233 Sobic006G210233 Sobic004G175800--Sobic006G210233 Sobic004G175800--Sobic003G257650 Sobic004G175800--Sobic003G094900 Sobic004G175800--Sobic003G432400 Sobic003G257650--Sobic002G367000 Sobic003G257650--Sobic003G394150 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic003G257650--Sobic001G175200 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic003G257650--Sobic010G226100 Sobic003G257650--Sobic010G020000 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic003G257650--Sobic005G078600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic003G257650--Sobic007G190600 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G257650--Sobic006G038050 Sobic006G241500 Sobic006G241500 Sobic003G257650--Sobic006G241500 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic010G020000--Sobic003G373050 Sobic008G179400--Sobic004G175800 Sobic008G179400--Sobic001G505033 Sobic008G179400--Sobic006G210233 Sobic008G179400--Sobic005G224601 Sobic005G165950 Sobic005G165950 Sobic008G179400--Sobic005G165950 Sobic001G324000 Sobic001G324000 Sobic008G179400--Sobic001G324000 Sobic008G179400--Sobic002G395400 Sobic008G179400--Sobic003G094900 Sobic006G089350 Sobic006G089350 Sobic008G179400--Sobic006G089350 Sobic002G071201 Sobic002G071201 Sobic003G094900--Sobic002G071201 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G094900--Sobic010G203400 Sobic003G094900--Sobic004G175800 Sobic003G094900--Sobic001G505033 Sobic003G094900--Sobic002G395400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic003G094900--Sobic006G090450 Sobic003G094900--Sobic008G179400 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic003G094900--Sobic008G142450 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic003G094900--Sobic003G327950 Sobic007G043750--Sobic003G432400 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic007G043750--Sobic009G258000 Sobic007G043750--Sobic004G175800 Sobic007G043750--Sobic003G394150 Sobic007G043750--Sobic003G257650 Sobic007G043750--Sobic002G395400 Sobic007G043750--Sobic008G179400 Sobic007G043750--Sobic010G226100 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic007G043750--Sobic001G035700 Sobic002G204700--Sobic003G394150 Sobic002G204700--Sobic001G143850 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic002G395400 Sobic002G204700--Sobic009G053700 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic001G035700 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic002G204700--Sobic010G172633 Sobic002G204700--Sobic004G224733 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic001G397550 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic004G224733--Sobic004G332200 Sobic004G224733--Sobic003G327950 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic004G224733--Sobic006G219400 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G224733--Sobic007G028300 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G224733--Sobic004G078200 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic004G224733--Sobic004G282966 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic004G224733--Sobic006G074600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G224733--Sobic003G139600
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