Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G308350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8G2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G246800 - -
2 Sobic.009G178650 - -
3 Sobic.009G077901 - -
4 Sobic.003G116200 expressed protein -
5 Sobic.001G143850 - -
6 Sobic.002G204700 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.009G053700 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
8 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G394150 - -
10 Sobic.003G013300 expressed protein -
11 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
12 Sobic.010G214150 - -
13 Sobic.003G373050 - -
14 Sobic.002G108900 transporter family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G314350 - -
16 Sobic.005G122000 LGC1, putative, expressed -
17 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
18 Sobic.002G395400 - -
19 Sobic.004G224733 - -
20 Sobic.006G216150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G308350--Sobic010G246800 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic001G308350--Sobic009G178650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic001G308350--Sobic009G077901 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic001G308350--Sobic003G116200 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic001G308350--Sobic001G143850 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic002G204700 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G308350--Sobic009G053700 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G308350--Sobic010G120900 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G308350--Sobic003G394150 Sobic010G246800--Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic003G116200 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G308350 Sobic010G246800--Sobic001G143850 Sobic010G246800--Sobic009G053700 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic010G214150 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic010G246800--Sobic002G312550 Sobic009G178650--Sobic009G077901 Sobic009G178650--Sobic009G053700 Sobic009G178650--Sobic010G246800 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic009G178650--Sobic003G373050 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic009G178650--Sobic004G159866 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic009G178650--Sobic001G235600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic009G178650--Sobic002G018200 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic009G178650--Sobic010G020000 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic009G178650--Sobic002G168700 Sobic009G077901--Sobic009G178650 Sobic009G077901--Sobic003G373050 Sobic009G077901--Sobic010G246800 Sobic009G077901--Sobic001G235600 Sobic009G077901--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic009G077901--Sobic004G334501 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic009G053700 Sobic009G077901--Sobic004G159866 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500 Sobic002G204700--Sobic003G394150 Sobic002G204700--Sobic001G143850 Sobic002G204700--Sobic001G308350 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic002G204700--Sobic002G395400 Sobic002G204700--Sobic009G053700 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic006G216150 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic002G204700--Sobic001G035700 Sobic002G204700--Sobic010G172633 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic002G204700--Sobic004G224733 Sobic009G053700--Sobic009G178650 Sobic009G053700--Sobic010G020000 Sobic009G053700--Sobic001G143850 Sobic009G053700--Sobic004G216650 Sobic009G053700--Sobic009G077901 Sobic009G053700--Sobic004G159866 Sobic009G053700--Sobic010G246800 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic003G394150 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic010G120900--Sobic001G505066 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G120900--Sobic003G192500 Sobic010G120900--Sobic003G116200 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G120900--Sobic002G190600 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic010G120900--Sobic007G202360 Sobic010G120900--Sobic001G314350 Sobic010G120900--Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic010G246800 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic010G120900--Sobic003G123900 Sobic003G394150--Sobic002G395400 Sobic003G394150--Sobic010G020000 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic009G053700 Sobic003G394150--Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic002G204700 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic003G432400 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic003G394150--Sobic007G043750 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G394150--Sobic002G367000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.