Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G246800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YLB3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G178650 - -
2 Sobic.009G077901 - -
3 Sobic.003G116200 expressed protein -
4 Sobic.001G314350 - -
5 Sobic.001G308350 - -
6 Sobic.001G143850 - -
7 Sobic.009G053700 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
8 Sobic.010G214150 - -
9 Sobic.002G312550 - -
10 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
11 Sobic.005G122000 LGC1, putative, expressed -
12 Sobic.003G013300 expressed protein -
13 Sobic.010G120900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G210266 - -
15 Sobic.004G206050 - -
16 Sobic.004G216650 - -
17 Sobic.006G216150 - -
18 Sobic.003G373050 - -
19 Sobic.009G148400 - -
20 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G178650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic009G077901 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic010G246800--Sobic003G116200 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G314350 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic010G246800--Sobic001G308350 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic010G246800--Sobic001G143850 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic010G246800--Sobic009G053700 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic010G214150 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic010G246800--Sobic002G312550 Sobic009G178650--Sobic009G077901 Sobic009G178650--Sobic009G053700 Sobic009G178650--Sobic010G246800 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic009G178650--Sobic003G373050 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic009G178650--Sobic004G159866 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic009G178650--Sobic001G235600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic009G178650--Sobic002G018200 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic009G178650--Sobic010G020000 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic009G178650--Sobic002G168700 Sobic009G077901--Sobic009G178650 Sobic009G077901--Sobic003G373050 Sobic009G077901--Sobic010G246800 Sobic009G077901--Sobic001G235600 Sobic009G077901--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic009G077901--Sobic004G334501 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic003G013300 Sobic009G077901--Sobic009G053700 Sobic009G077901--Sobic004G159866 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic001G314350--Sobic003G116200 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic001G314350--Sobic004G073232 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic002G312550 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic006G243300 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic001G314350--Sobic001G152150 Sobic001G308350--Sobic010G246800 Sobic001G308350--Sobic009G178650 Sobic001G308350--Sobic009G077901 Sobic001G308350--Sobic003G116200 Sobic001G308350--Sobic001G143850 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic009G053700 Sobic001G308350--Sobic010G120900 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G308350--Sobic003G394150 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500 Sobic009G053700--Sobic009G178650 Sobic009G053700--Sobic010G020000 Sobic009G053700--Sobic001G143850 Sobic009G053700--Sobic004G216650 Sobic009G053700--Sobic009G077901 Sobic009G053700--Sobic004G159866 Sobic009G053700--Sobic010G246800 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic003G394150 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic002G312550--Sobic001G314350
Octagon: transcription factors


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