Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G216650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RP00
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G136500 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G075100 receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.001G143850 - -
4 Sobic.002G287300 proteophosphoglycan ppg4, putative, expressed -
5 Sobic.009G053700 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
6 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
7 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
8 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
9 Sobic.001G111650 - -
10 Sobic.007G083700 - -
11 Sobic.003G244250 - -
12 Sobic.001G436450 - -
13 Sobic.004G159866 - -
14 Sobic.009G178650 - -
15 Sobic.003G147800 expressed protein -
16 Sobic.002G246100 - -
17 Sobic.005G026966 - -
18 Sobic.004G260250 - -
19 Sobic.006G171801 - -
20 Sobic.010G172633 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic004G216650--Sobic002G136500 Sobic002G075100 Sobic002G075100 Sobic004G216650--Sobic002G075100 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic004G216650--Sobic001G143850 Sobic002G287300 Sobic002G287300 Sobic004G216650--Sobic002G287300 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic004G216650--Sobic009G053700 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic004G216650--Sobic001G315300 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic004G216650--Sobic010G020000 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic004G216650--Sobic003G416200 Sobic001G111650 Sobic001G111650 Sobic004G216650--Sobic001G111650 Sobic002G136500--Sobic004G216650 Sobic002G136500--Sobic002G075100 Sobic002G136500--Sobic002G287300 Sobic002G136500--Sobic001G111650 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic002G136500--Sobic007G083700 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic002G136500--Sobic001G436450 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic002G136500--Sobic004G159866 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic002G136500--Sobic003G244250 Sobic002G136500--Sobic001G143850 Sobic002G075100--Sobic002G136500 Sobic002G075100--Sobic007G083700 Sobic002G075100--Sobic004G216650 Sobic002G075100--Sobic004G159866 Sobic002G075100--Sobic001G111650 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic002G075100--Sobic002G168750 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic002G075100--Sobic008G167900 Sobic002G075100--Sobic001G436450 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic002G075100--Sobic001G087850 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic001G143850--Sobic002G136500 Sobic002G287300--Sobic004G216650 Sobic002G287300--Sobic002G136500 Sobic002G287300--Sobic002G075100 Sobic002G287300--Sobic001G143850 Sobic002G287300--Sobic010G020000 Sobic002G287300--Sobic001G315300 Sobic002G287300--Sobic003G416200 Sobic002G287300--Sobic009G053700 Sobic002G287300--Sobic003G244250 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic009G053700--Sobic009G178650 Sobic009G053700--Sobic010G020000 Sobic009G053700--Sobic001G143850 Sobic009G053700--Sobic004G216650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic009G053700--Sobic009G077901 Sobic009G053700--Sobic004G159866 Sobic009G053700--Sobic010G246800 Sobic009G053700--Sobic007G083700 Sobic009G053700--Sobic003G394150 Sobic001G315300--Sobic010G172633 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic001G315300--Sobic002G109900 Sobic001G315300--Sobic001G143850 Sobic001G315300--Sobic004G216650 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic001G315300--Sobic003G147800 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic001G315300--Sobic001G184950 Sobic001G315300--Sobic002G136500 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic001G315300--Sobic001G074900 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic001G315300--Sobic002G286500 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic010G020000--Sobic003G373050 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic003G416200--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic003G416200--Sobic003G172966 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic003G416200--Sobic006G216150 Sobic003G416200--Sobic001G436450 Sobic003G416200--Sobic003G244250 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G206050 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic003G416200--Sobic004G332200 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G416200--Sobic003G056200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic003G416200--Sobic010G136700 Sobic001G111650--Sobic002G075100 Sobic001G111650--Sobic007G083700 Sobic001G111650--Sobic002G136500 Sobic001G111650--Sobic004G159866 Sobic001G111650--Sobic004G216650 Sobic001G111650--Sobic002G168750 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic001G111650--Sobic004G260250 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic001G111650--Sobic002G163400 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic001G111650--Sobic003G263450
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.