Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G287300.3,Sobic.002G287300.5,Sobic.002G287300.4,Sobic.002G287300.2
Synonym Sb02g031960
Functional annotation proteophosphoglycan ppg4, putative, expressed
UniProt A0A1W0W699 , C5X7L4
Pfam -
Panther DB PTHR34555:SF2 PTHR34555 PTHR34555 PTHR34555:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38280 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37700.1 : proteophosphoglycan ppg4, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014505
Brachypodium KQJ91352 , KQJ91353 , KQJ91354 , KQJ91355 , KQJ91356 , KQJ91357 , PNT65086
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G216650 - -
2 Sobic.002G136500 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G075100 receptor kinase, putative, expressed -
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8 Sobic.009G053700 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
9 Sobic.003G244250 - -
10 Sobic.007G083700 - -
11 Sobic.001G111650 - -
12 Sobic.003G147800 expressed protein -
13 Sobic.004G159866 - -
14 Sobic.001G436450 - -
15 Sobic.009G178650 - -
16 Sobic.010G172633 - -
17 Sobic.002G246100 - -
18 Sobic.004G260250 - -
19 Sobic.010G246800 - -
20 Sobic.003G394150 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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