Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G148400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P939
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G206000 - -
2 Sobic.004G249950 - -
3 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
4 Sobic.001G081450 - -
5 Sobic.004G223700 - -
6 Sobic.K032600 - -
7 Sobic.007G116150 - -
8 Sobic.007G134300 - -
9 Sobic.K032400 - -
10 Sobic.002G112200 - -
11 Sobic.002G126700 - -
12 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
13 Sobic.002G073000 - -
14 Sobic.001G050650 - -
15 Sobic.009G095720 - -
16 Sobic.007G098050 - -
17 Sobic.002G112500 - -
18 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
19 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G209650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G148400--Sobic004G206000 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic009G148400--Sobic004G249950 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic009G148400--Sobic010G098800 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic009G148400--Sobic001G081450 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic009G148400--Sobic004G223700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic009G148400--SobicK032600 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic009G148400--Sobic007G116150 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic009G148400--Sobic007G134300 SobicK032400 SobicK032400 Sobic009G148400--SobicK032400 Sobic004G206000--SobicK032600 Sobic004G206000--SobicK032400 Sobic004G206000--Sobic001G081450 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic004G206000--Sobic007G098050 Sobic004G206000--Sobic007G116150 Sobic004G206000--Sobic004G223700 Sobic004G206000--Sobic010G098800 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic004G206000--Sobic006G264400 Sobic004G206000--Sobic007G134300 Sobic004G249950--Sobic009G148400 Sobic004G249950--Sobic010G098800 Sobic004G249950--Sobic001G081450 Sobic004G249950--Sobic004G223700 Sobic004G249950--Sobic004G206000 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic004G249950--Sobic007G045750 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic004G249950--Sobic002G073000 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G249950--Sobic010G219200 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic004G249950--Sobic009G158150 Sobic010G098800--Sobic004G223700 Sobic010G098800--Sobic007G116150 Sobic010G098800--Sobic001G081450 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic010G098800--Sobic003G173200 Sobic010G098800--Sobic004G206000 Sobic010G098800--SobicK032600 Sobic010G098800--Sobic009G148400 Sobic010G098800--SobicK032400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic010G098800--Sobic003G268100 Sobic001G081450--Sobic004G223700 Sobic001G081450--Sobic007G116150 Sobic001G081450--SobicK032600 Sobic001G081450--Sobic004G206000 Sobic001G081450--SobicK032400 Sobic001G081450--Sobic010G098800 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G081450--Sobic002G112500 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G081450--Sobic004G272950 Sobic001G081450--Sobic009G148400 Sobic004G223700--Sobic010G098800 Sobic004G223700--Sobic001G081450 Sobic004G223700--Sobic004G272950 Sobic004G223700--Sobic007G116150 Sobic004G223700--Sobic004G206000 Sobic004G223700--SobicK032600 Sobic004G223700--SobicK032400 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic004G223700--Sobic003G168600 SobicK031300 SobicK031300 Sobic004G223700--SobicK031300 SobicK032600--SobicK032400 SobicK032600--Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032350 SobicK032350 SobicK032600--SobicK032350 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic007G098050 SobicK032600--Sobic007G134300 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK032600--Sobic009G209650 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic007G116150--Sobic010G143700 Sobic007G116150--Sobic003G268100 Sobic007G116150--SobicK032400 Sobic007G116150--SobicK032600 Sobic007G116150--Sobic010G098800 Sobic007G116150--Sobic001G081450 Sobic007G116150--Sobic009G209650 Sobic007G116150--Sobic004G223700 Sobic007G116150--Sobic003G173200 Sobic007G134300--SobicK032600 Sobic007G134300--SobicK032400 Sobic007G134300--Sobic004G206000 Sobic007G134300--Sobic007G116150 Sobic007G134300--Sobic009G209650 Sobic007G134300--SobicK032350 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic007G134300--Sobic002G126700 Sobic007G134300--SobicK031300 Sobic007G134300--Sobic001G081450 SobicK032400--SobicK032600 SobicK032400--Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 SobicK032400--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic006G029850 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic001G081450
Octagon: transcription factors


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