Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G216150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RF13
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
2 Sobic.004G332200 - -
3 Sobic.009G097400 - -
4 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
5 Sobic.004G282966 - -
6 Sobic.007G090433 - -
7 Sobic.010G136700 - -
8 Sobic.003G056200 - -
9 Sobic.003G244250 - -
10 Sobic.001G016050 - -
11 Sobic.001G436450 - -
12 Sobic.003G147800 expressed protein -
13 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
14 Sobic.001G255866 - -
15 Sobic.001G143850 - -
16 Sobic.006G217400 expressed protein -
17 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
19 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
20 Sobic.004G206050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic006G216150--Sobic003G416200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic006G216150--Sobic004G332200 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic006G216150--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic006G216150--Sobic003G172966 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic006G216150--Sobic004G282966 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic006G216150--Sobic007G090433 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic006G216150--Sobic010G136700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic006G216150--Sobic003G056200 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic006G216150--Sobic003G244250 Sobic003G416200--Sobic009G097400 Sobic003G416200--Sobic003G172966 Sobic003G416200--Sobic006G216150 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G416200--Sobic001G436450 Sobic003G416200--Sobic003G244250 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G332200 Sobic003G416200--Sobic003G056200 Sobic003G416200--Sobic010G136700 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G332200--Sobic005G154600 Sobic009G097400--Sobic003G416200 Sobic009G097400--Sobic003G172966 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic009G097400--Sobic009G204501 Sobic009G097400--Sobic003G056200 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic009G097400--Sobic004G126050 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic009G097400--Sobic001G255866 Sobic009G097400--Sobic001G436450 Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic009G097400--Sobic003G322600 SobicK032200 SobicK032200 Sobic009G097400--SobicK032200 Sobic003G172966--Sobic003G056200 Sobic003G172966--SobicK032200 Sobic003G172966--Sobic004G126050 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic003G172966--Sobic001G475950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic003G172966--Sobic006G107700 Sobic003G172966--Sobic009G097400 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G172966--Sobic001G261444 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic003G172966--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic003G172966--Sobic004G115100 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G282966--Sobic003G139600 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G395600 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic004G282966--Sobic001G465600 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G244250 Sobic004G282966--Sobic004G332200 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G282966--Sobic010G002301 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic004G224733 Sobic007G090433--Sobic001G255866 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic007G090433--Sobic007G116300 Sobic007G090433--Sobic004G276600 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic001G420150 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic007G090433--Sobic001G093400 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic001G423200 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic007G090433--Sobic004G133201 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G136700--Sobic008G119600 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic001G016050 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic010G136700--Sobic010G132400 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic010G136700--Sobic008G115200 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic006G107766 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic010G136700--Sobic007G004400 Sobic010G136700--Sobic007G090433 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G136700--Sobic005G090800 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic010G136700--Sobic002G212900 Sobic003G056200--Sobic003G172966 Sobic003G056200--Sobic001G475950 Sobic003G056200--Sobic006G107700 Sobic003G056200--SobicK032200 Sobic003G056200--Sobic004G126050 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic003G056200--Sobic002G401533 Sobic003G056200--Sobic001G261444 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic003G056200--Sobic002G358450 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G056200--Sobic003G161900 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic003G244250--Sobic002G246100 Sobic003G244250--Sobic001G436450 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G244250--Sobic004G260250 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic003G244250--Sobic009G079400 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic003G244250--Sobic004G187701 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G244250--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic003G416200 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic003G244250--Sobic004G207733
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.