Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G217400.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RF18
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009973
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
2 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
4 Sobic.K032200 ATP synthase protein MI25, putative, expressed -
5 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
6 Sobic.003G056200 - -
7 Sobic.K031900 - -
8 Sobic.001G261444 - -
9 Sobic.008G100201 - -
10 Sobic.001G255866 - -
11 Sobic.001G383350 - -
12 Sobic.009G097400 - -
13 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
14 Sobic.001G475950 - -
15 Sobic.004G126050 - -
16 Sobic.006G029850 - -
17 Sobic.002G401533 - -
18 Sobic.006G107766 - -
19 Sobic.009G257000 - -
20 Sobic.003G322600 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic006G217400--Sobic003G172966 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic006G217400--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G217400--Sobic004G115100 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G217400--SobicK032200 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic006G217400--Sobic006G107700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic006G217400--Sobic003G056200 SobicK031900 SobicK031900 Sobic006G217400--SobicK031900 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G217400--Sobic001G261444 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic006G217400--Sobic008G100201 Sobic003G172966--Sobic003G056200 Sobic003G172966--SobicK032200 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic003G172966--Sobic004G126050 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic003G172966--Sobic001G475950 Sobic003G172966--Sobic006G107700 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic003G172966--Sobic009G097400 Sobic003G172966--Sobic001G261444 Sobic003G172966--Sobic007G200700 Sobic003G172966--Sobic004G115100 Sobic007G200700--Sobic004G115100 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic007G200700--Sobic001G383350 Sobic007G200700--Sobic001G261444 Sobic007G200700--Sobic008G100201 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic007G200700--Sobic006G029850 Sobic007G200700--SobicK031900 Sobic007G200700--SobicK032200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic007G200700--Sobic010G143700 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G200700--Sobic006G035350 Sobic004G115100--Sobic008G100201 Sobic004G115100--Sobic007G200700 Sobic004G115100--Sobic001G383350 Sobic004G115100--Sobic006G029850 Sobic004G115100--Sobic001G261444 Sobic004G115100--SobicK031900 Sobic004G115100--Sobic006G035350 Sobic004G115100--Sobic010G143700 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G115100--Sobic006G107766 SobicK032200--Sobic001G475950 SobicK032200--Sobic001G261444 Sobic010G201332 Sobic010G201332 SobicK032200--Sobic010G201332 SobicK032200--Sobic003G172966 SobicK032200--Sobic004G126050 SobicK032200--Sobic003G056200 SobicK032200--Sobic001G383350 Sobic001G506200 Sobic001G506200 SobicK032200--Sobic001G506200 SobicK032200--Sobic006G029850 Sobic006G107700--Sobic003G056200 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic006G107700--Sobic002G401533 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic006G107700--Sobic009G257000 Sobic006G107700--Sobic003G172966 Sobic006G107700--Sobic001G475950 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic006G107700--Sobic003G161900 Sobic006G107700--Sobic001G261444 Sobic006G107700--SobicK032200 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic006G107700--Sobic001G037033 Sobic003G056200--Sobic003G172966 Sobic003G056200--Sobic001G475950 Sobic003G056200--Sobic006G107700 Sobic003G056200--SobicK032200 Sobic003G056200--Sobic004G126050 Sobic003G056200--Sobic002G401533 Sobic003G056200--Sobic001G261444 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic003G056200--Sobic002G358450 Sobic003G056200--Sobic003G161900 SobicK031900--Sobic008G100201 SobicK031900--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic004G115100 SobicK031900--Sobic007G200700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK031900--Sobic007G116150 SobicK031400 SobicK031400 SobicK031900--SobicK031400 SobicK031900--Sobic006G035350 SobicK031900--Sobic001G383350 Sobic001G261444--SobicK032200 Sobic001G261444--Sobic007G200700 Sobic001G261444--Sobic001G383350 Sobic001G261444--Sobic004G115100 Sobic001G261444--Sobic001G475950 Sobic001G261444--Sobic003G161900 Sobic001G261444--Sobic006G029850 Sobic001G261444--Sobic010G201332 Sobic001G261444--Sobic008G100201 Sobic008G100201--Sobic004G115100 Sobic008G100201--Sobic007G200700 Sobic008G100201--Sobic006G035350 Sobic008G100201--SobicK031900 Sobic008G100201--Sobic010G143700 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic008G100201--Sobic003G260500 Sobic008G100201--Sobic001G383350 Sobic008G100201--Sobic006G029850 Sobic008G100201--Sobic001G261444
Octagon: transcription factors


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