Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G282966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ08
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G139600 expressed protein -
2 Sobic.001G395600 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G147800 expressed protein -
5 Sobic.003G244250 - -
6 Sobic.004G332200 - -
7 Sobic.010G002301 - -
8 Sobic.010G176000 - -
9 Sobic.004G224733 - -
10 Sobic.007G116300 - -
11 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
12 Sobic.009G204501 - -
13 Sobic.006G059150 - -
14 Sobic.007G090433 - -
15 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.001G420150 - -
17 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.001G201933 - -
19 Sobic.001G255866 - -
20 Sobic.007G113566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G282966--Sobic003G139600 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G395600 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic004G282966--Sobic001G465600 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G147800 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G282966--Sobic003G244250 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic004G282966--Sobic004G332200 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G282966--Sobic010G002301 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic010G176000 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic004G282966--Sobic004G224733 Sobic003G139600--Sobic010G002301 Sobic003G139600--Sobic001G465600 Sobic003G139600--Sobic004G282966 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic003G139600--Sobic001G201933 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic003G139600--Sobic007G113566 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic001G395600 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic003G139600--Sobic004G157050 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic003G139600--Sobic001G331650 Sobic001G395600--Sobic003G139600 Sobic001G395600--Sobic004G282966 Sobic001G395600--Sobic001G465600 Sobic001G395600--Sobic004G207800 Sobic001G395600--Sobic010G002301 Sobic001G395600--Sobic001G331650 Sobic001G395600--Sobic007G113566 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G395600--Sobic004G078200 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G395600--Sobic008G171200 Sobic001G465600--Sobic010G002301 Sobic001G465600--Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic001G331650 Sobic001G465600--Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic007G113566 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G465600--Sobic006G219400 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic001G201933 Sobic003G147800--Sobic004G282966 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic003G147800--Sobic003G416200 Sobic003G147800--Sobic003G244250 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic003G147800--Sobic001G074900 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic003G147800--Sobic002G246100 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic003G147800--Sobic001G315300 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic003G147800--Sobic001G016050 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G147800--Sobic001G143850 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic003G147800--Sobic002G157050 Sobic003G244250--Sobic002G246100 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G244250--Sobic001G436450 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G244250--Sobic004G260250 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic003G244250--Sobic009G079400 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic003G244250--Sobic004G187701 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G244250--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic003G416200 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic003G244250--Sobic004G207733 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G332200--Sobic005G154600 Sobic010G002301--Sobic003G139600 Sobic010G002301--Sobic001G465600 Sobic010G002301--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic004G157050 Sobic010G002301--Sobic007G113566 Sobic010G002301--Sobic002G191900 Sobic010G002301--Sobic008G171200 Sobic010G002301--Sobic001G331650 Sobic010G002301--Sobic004G207800 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic010G176000--Sobic009G204501 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic010G176000--Sobic001G205950 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic010G176000--Sobic003G238750 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic010G176000--Sobic005G021400 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic010G176000--Sobic007G116300 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic010G176000--Sobic003G286450 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic010G176000--Sobic001G171700 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G176000--Sobic001G037033 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic010G176000--Sobic010G053700 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic004G332200 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G224733--Sobic003G327950 Sobic004G224733--Sobic006G219400 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G224733--Sobic007G028300 Sobic004G224733--Sobic004G078200 Sobic004G224733--Sobic004G282966 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic004G224733--Sobic006G074600 Sobic004G224733--Sobic003G139600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.