Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G176000.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTN1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G204501 - -
2 Sobic.001G205950 - -
3 Sobic.003G238750 - -
4 Sobic.005G021400 - -
5 Sobic.007G116300 - -
6 Sobic.003G286450 - -
7 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
8 Sobic.001G037033 - -
9 Sobic.010G053700 expressed protein -
10 Sobic.002G159750 - -
11 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.001G476800 - -
13 Sobic.010G175550 - -
14 Sobic.001G118050 - -
15 Sobic.007G090433 - -
16 Sobic.001G255866 - -
17 Sobic.001G093400 - -
18 Sobic.009G257000 - -
19 Sobic.001G535850 - -
20 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic010G176000--Sobic009G204501 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic010G176000--Sobic001G205950 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic010G176000--Sobic003G238750 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic010G176000--Sobic005G021400 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic010G176000--Sobic007G116300 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic010G176000--Sobic003G286450 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic010G176000--Sobic001G171700 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G176000--Sobic001G037033 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic010G176000--Sobic010G053700 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic009G204501--Sobic001G255866 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic009G204501--Sobic003G056200 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic009G204501--Sobic006G107700 Sobic009G204501--Sobic010G176000 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic009G204501--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic009G204501--Sobic003G172966 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic009G204501--Sobic009G257000 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic009G204501--Sobic002G083332 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic009G204501--Sobic007G090433 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic010G176000 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic008G116800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic001G205950--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic004G129400 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G205950--Sobic003G394701 Sobic001G205950--Sobic003G238750 Sobic001G205950--Sobic010G053700 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic001G205950--Sobic007G046700 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic003G238750--Sobic010G175550 Sobic003G238750--Sobic010G176000 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G238750--Sobic001G476800 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic003G238750--Sobic004G322650 Sobic003G238750--Sobic001G205950 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G238750--Sobic002G159750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic003G238750--Sobic008G171200 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic003G238750--Sobic004G193350 Sobic003G238750--Sobic001G171700 Sobic005G021400--Sobic010G176000 Sobic005G021400--Sobic009G204501 Sobic005G021400--Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic003G286450 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G255866 Sobic005G021400--Sobic010G053700 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G021400--Sobic001G535850 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic005G021400--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G093400 Sobic007G116300--Sobic001G255866 Sobic007G116300--Sobic007G090433 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic001G423200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G116300--Sobic004G276600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic004G129400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G116300--Sobic006G059150 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic004G322650 Sobic001G171700--Sobic008G171200 Sobic001G171700--Sobic010G176000 Sobic001G171700--Sobic009G204501 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic001G171700--Sobic002G380550 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic001G171700--Sobic006G035200 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic001G358366 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G171700--Sobic004G157050 Sobic001G037033--Sobic006G107700 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G037033--Sobic002G401533 Sobic001G037033--Sobic009G257000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic001G037033--Sobic010G169950 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic001G037033--Sobic001G094550 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G037033--Sobic009G210250 Sobic001G037033--Sobic002G159750 Sobic001G037033--Sobic007G090433 Sobic001G037033--Sobic003G056200 Sobic010G053700--Sobic006G059150 Sobic010G053700--Sobic007G116300 Sobic010G053700--Sobic010G176000 Sobic010G053700--Sobic004G129400 Sobic010G053700--Sobic001G205950 Sobic010G053700--Sobic008G156800 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic010G053700--Sobic003G396050 Sobic010G053700--Sobic001G420150 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic010G053700--Sobic001G118050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.