Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G021400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPS2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G176000 - -
2 Sobic.009G204501 - -
3 Sobic.007G116300 - -
4 Sobic.003G286450 - -
5 Sobic.001G093400 - -
6 Sobic.001G255866 - -
7 Sobic.010G053700 expressed protein -
8 Sobic.001G535850 - -
9 Sobic.001G420150 - -
10 Sobic.007G090433 - -
11 Sobic.009G257000 - -
12 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.009G260550 - -
14 Sobic.001G205950 - -
15 Sobic.001G118050 - -
16 Sobic.001G037033 - -
17 Sobic.001G476800 - -
18 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
19 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic005G021400--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic005G021400--Sobic009G204501 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic005G021400--Sobic007G116300 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G021400--Sobic003G286450 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic005G021400--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic005G021400--Sobic001G255866 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic005G021400--Sobic010G053700 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G021400--Sobic001G535850 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic005G021400--Sobic001G420150 Sobic010G176000--Sobic009G204501 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic010G176000--Sobic001G205950 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic010G176000--Sobic003G238750 Sobic010G176000--Sobic005G021400 Sobic010G176000--Sobic007G116300 Sobic010G176000--Sobic003G286450 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic010G176000--Sobic001G171700 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G176000--Sobic001G037033 Sobic010G176000--Sobic010G053700 Sobic009G204501--Sobic001G255866 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic009G204501--Sobic003G056200 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic009G204501--Sobic006G107700 Sobic009G204501--Sobic010G176000 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic009G204501--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic009G204501--Sobic003G172966 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic009G204501--Sobic009G257000 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic009G204501--Sobic002G083332 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic009G204501--Sobic007G090433 Sobic007G116300--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G093400 Sobic007G116300--Sobic001G255866 Sobic007G116300--Sobic007G090433 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic001G423200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G116300--Sobic004G276600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic009G260550 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic007G116300--Sobic004G129400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G116300--Sobic006G059150 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic001G093400--Sobic007G116300 Sobic001G093400--Sobic001G420150 Sobic001G093400--Sobic009G260550 Sobic001G093400--Sobic009G257000 Sobic001G093400--Sobic001G255866 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G093400--Sobic003G169700 Sobic001G093400--Sobic007G090433 Sobic001G093400--Sobic004G276600 Sobic001G093400--Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G255866--Sobic004G133201 Sobic010G053700--Sobic006G059150 Sobic010G053700--Sobic007G116300 Sobic010G053700--Sobic010G176000 Sobic010G053700--Sobic004G129400 Sobic010G053700--Sobic001G205950 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic010G053700--Sobic008G156800 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic010G053700--Sobic003G396050 Sobic010G053700--Sobic001G420150 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic010G053700--Sobic001G118050 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic001G420150--Sobic003G169700
Octagon: transcription factors


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