Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G238750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYN9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G175550 - -
2 Sobic.010G176000 - -
3 Sobic.001G476800 - -
4 Sobic.004G322650 - -
5 Sobic.001G205950 - -
6 Sobic.002G159750 - -
7 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
8 Sobic.004G193350 - -
9 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
10 Sobic.001G118050 - -
11 Sobic.003G286450 - -
12 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G113566 - -
14 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.009G204501 - -
16 Sobic.006G135701 - -
17 Sobic.001G037033 - -
18 Sobic.005G021400 - -
19 Sobic.010G053700 expressed protein -
20 Sobic.001G182900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic003G238750--Sobic010G175550 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic003G238750--Sobic010G176000 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G238750--Sobic001G476800 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic003G238750--Sobic004G322650 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic003G238750--Sobic001G205950 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G238750--Sobic002G159750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic003G238750--Sobic008G171200 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic003G238750--Sobic004G193350 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic003G238750--Sobic001G171700 Sobic010G175550--Sobic001G476800 Sobic010G175550--Sobic008G171200 Sobic010G175550--Sobic003G238750 Sobic010G175550--Sobic002G159750 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G175550--Sobic001G182900 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic010G175550--Sobic007G113566 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic010G175550--Sobic004G019550 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic010G175550--Sobic001G118050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic010G175550--Sobic003G286450 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic010G176000--Sobic009G204501 Sobic010G176000--Sobic001G205950 Sobic010G176000--Sobic003G238750 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic010G176000--Sobic005G021400 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic010G176000--Sobic007G116300 Sobic010G176000--Sobic003G286450 Sobic010G176000--Sobic001G171700 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic010G176000--Sobic001G037033 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic010G176000--Sobic010G053700 Sobic001G476800--Sobic008G171200 Sobic001G476800--Sobic010G175550 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic003G286450 Sobic001G476800--Sobic004G019550 Sobic001G476800--Sobic002G159750 Sobic001G476800--Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic001G182900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G476800--Sobic004G207800 Sobic004G322650--Sobic008G171200 Sobic004G322650--Sobic001G171700 Sobic004G322650--Sobic003G238750 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic004G322650--Sobic001G278650 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic004G157050 Sobic004G322650--Sobic001G476800 Sobic004G322650--Sobic001G182900 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic004G322650--Sobic005G216900 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic004G322650--Sobic002G157050 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic008G156800 Sobic001G205950--Sobic010G176000 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic008G116800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic001G205950--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic004G129400 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G205950--Sobic003G394701 Sobic001G205950--Sobic003G238750 Sobic001G205950--Sobic010G053700 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic001G205950--Sobic007G046700 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic008G171200--Sobic001G476800 Sobic008G171200--Sobic004G157050 Sobic008G171200--Sobic007G113566 Sobic008G171200--Sobic004G207800 Sobic008G171200--Sobic010G175550 Sobic008G171200--Sobic010G035600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G182900 Sobic008G171200--Sobic003G286450 Sobic004G193350--Sobic002G159750 Sobic004G193350--Sobic003G238750 Sobic004G193350--Sobic004G322650 Sobic004G193350--Sobic001G476800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic004G193350--Sobic005G137500 Sobic004G193350--Sobic008G171200 Sobic004G193350--Sobic010G175550 Sobic004G193350--Sobic003G286450 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic004G193350--Sobic003G016950 Sobic001G171700--Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic004G322650 Sobic001G171700--Sobic008G171200 Sobic001G171700--Sobic010G176000 Sobic001G171700--Sobic009G204501 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic001G171700--Sobic002G380550 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic001G171700--Sobic006G035200 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic004G157050
Octagon: transcription factors


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