Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G217200.1
Synonym CCoAOMT1, SbCCoAOMT-6, SbCCoAOMT-like genes;caffeoyl-coenzyme A O-methyltransferases-like protein, Sb07g028360
Functional annotation (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity. (PubMedID : 27457122)
Functions are not investigated (PubMedID : 29721721)
caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed
UniProt C5YJ84
Pfam PF01596
Panther DB PTHR10509 PTHR10509:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008171; O-methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G34050 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38900.1 : caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033741 , Zm00025a033742
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G442400 , TraesCS7A02G240300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G039750 - -
2 Sobic.010G175550 - -
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14 Sobic.002G009000 - -
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17 Sobic.002G181066 - -
18 Sobic.005G139750 - -
19 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G182900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G217200 Sobic007G217200 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic007G217200--Sobic001G039750 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic007G217200--Sobic010G175550 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic007G217200--Sobic002G159750 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic007G217200--Sobic003G238750 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic007G217200--Sobic001G476800 Sobic006G122000 Sobic006G122000 Sobic007G217200--Sobic006G122000 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic007G217200--Sobic010G196466 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic007G217200--Sobic003G069400 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic007G217200--Sobic009G210250 Sobic001G039750--Sobic007G217200 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic001G039750--Sobic006G263250 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic001G039750--Sobic007G011100 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic001G039750--Sobic001G136850 Sobic001G039750--Sobic003G069400 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G039750--Sobic002G220400 Sobic009G058900 Sobic009G058900 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