Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G181066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4M5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G229850 - -
2 Sobic.003G069400 - -
3 Sobic.005G068000 expressed protein -
4 Sobic.003G124400 - -
5 Sobic.003G312900 - -
6 Sobic.002G067900 - -
7 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G174500 - -
9 Sobic.010G163666 - -
10 Sobic.006G048400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.002G009000 - -
12 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
13 Sobic.007G217200 (28.4% identity with SbCCoAOMT/37.4% similarity) unlikely to have any significant CCoAOMT activity.(PubMedID : 27457122)@Functions are not investigated(PubMedID : 29721721)@caffeoyl-CoA O-methyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.009G094200 - -
15 Sobic.001G190900 ABCG protein(PubMedID : 21265893)@"Orthologous gene of wheat Lr34 gene, expressed in accession AusTRCF 302546, but not expreesed in BTx623 possibly due to transposon insertions in intron 4"(PubMedID : 23117720)@pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
16 Sobic.010G196466 - -
17 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.006G258100 - -
19 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
20 Sobic.001G205950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic002G181066--Sobic001G229850 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic002G181066--Sobic003G069400 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic002G181066--Sobic005G068000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic002G181066--Sobic003G124400 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic002G181066--Sobic003G312900 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic002G181066--Sobic002G067900 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic002G181066--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic002G181066--Sobic003G174500 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G181066--Sobic010G163666 Sobic001G229850--Sobic003G312900 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic001G229850--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G229850--Sobic002G074900 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic001G229850--Sobic006G258100 Sobic001G229850--Sobic003G069400 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G229850--Sobic006G048400 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic001G229850--Sobic003G335000 Sobic001G229850--Sobic002G181066 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic001G229850--Sobic003G335100 Sobic003G069400--Sobic006G258100 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic003G069400--Sobic007G054200 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G069400--Sobic008G156800 Sobic003G069400--Sobic001G229850 Sobic003G069400--Sobic002G074900 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic003G069400--Sobic009G058900 Sobic003G069400--Sobic010G163666 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G069400--Sobic003G169550 Sobic003G069400--Sobic003G335100 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic003G312900--Sobic003G312800 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312900--Sobic004G209100 Sobic003G312900--Sobic001G229850 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312900--Sobic005G180850 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312900--Sobic001G190900 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G312900--Sobic008G132500 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic003G312900--Sobic001G226401 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic005G118800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G312900--Sobic003G232600 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G067900--Sobic008G115200 Sobic003G375500--Sobic005G027350 Sobic003G375500--Sobic010G183350 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic003G375500--Sobic009G074800 Sobic003G375500--Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic003G124400 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic003G375500--Sobic003G401700 Sobic003G375500--Sobic001G250750 Sobic003G375500--Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic009G026600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G174500--Sobic001G261452 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic003G174500--Sobic010G129100 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic010G133450 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic005G068000 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic003G174500--Sobic009G088300 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic009G186300 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic003G174500--Sobic003G118000 Sobic003G174500--Sobic002G181066 Sobic010G264150 Sobic010G264150 Sobic010G163666--Sobic010G264150 Sobic010G163666--Sobic007G054200 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic010G163666--Sobic007G046700 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic010G163666--Sobic002G171901 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G163666--Sobic002G009000 Sobic010G163666--Sobic002G074900 Sobic010G163666--Sobic002G067900 Sobic010G163666--Sobic003G069400 Sobic010G163666--Sobic001G250750
Octagon: transcription factors


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