Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G068000.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RHN6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G124400 - -
2 Sobic.001G239000 expressed protein -
3 Sobic.003G312800 - -
4 Sobic.008G037300 RCN1 Centroradialis-like1 homogous to TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
5 Sobic.005G027350 - -
6 Sobic.003G312900 - -
7 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G174500 - -
10 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.009G026600 - -
12 Sobic.001G229850 - -
13 Sobic.009G094200 - -
14 Sobic.002G181066 - -
15 Sobic.001G524750 - -
16 Sobic.001G261452 - -
17 Sobic.003G312600 expressed protein -
18 Sobic.001G476600 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
19 Sobic.010G183350 - -
20 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic003G124400--Sobic005G068000 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G079000 Sobic003G124400--Sobic001G239000 Sobic003G124400--Sobic003G375500 Sobic003G124400--Sobic008G037300 Sobic003G124400--Sobic005G027350 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic003G124400--Sobic010G183350 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic009G026600 Sobic003G124400--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G068000 Sobic001G239000--Sobic003G124400 Sobic001G239000--Sobic003G312800 Sobic001G239000--Sobic005G027350 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic001G239000--Sobic003G312600 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic002G398300 Sobic001G239000--Sobic008G037300 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G476600 Sobic001G239000--Sobic001G079000 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G027350 Sobic008G037300--Sobic005G068000 Sobic008G037300--Sobic009G026600 Sobic008G037300--Sobic002G309300 Sobic008G037300--Sobic003G124400 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic001G370800 Sobic008G037300--Sobic005G027350 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G037300--Sobic004G072201 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G038700 Sobic008G037300--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic009G026600 Sobic005G027350--Sobic003G375500 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic009G074800 Sobic005G027350--Sobic005G068000 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic001G460900 Sobic005G027350--Sobic003G312800 Sobic005G027350--Sobic001G239000 Sobic005G027350--Sobic008G037300 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic005G027350--Sobic003G401700 Sobic003G312900--Sobic003G312800 Sobic003G312900--Sobic004G209100 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic005G180850 Sobic003G312900--Sobic001G190900 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G312900--Sobic008G132500 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic003G312900--Sobic001G226401 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic005G118800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G312900--Sobic003G232600 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G309300--Sobic004G218400 Sobic002G309300--Sobic001G038700 Sobic002G309300--Sobic004G072201 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic002G309300--Sobic006G255200 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic006G268100 Sobic002G309300--Sobic001G370800 Sobic002G309300--Sobic009G026600 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic002G309300--Sobic001G442000 Sobic002G309300--Sobic008G037300 Sobic003G375500--Sobic005G027350 Sobic003G375500--Sobic010G183350 Sobic003G375500--Sobic009G074800 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic002G067900 Sobic003G375500--Sobic003G124400 Sobic003G375500--Sobic003G401700 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G375500--Sobic001G250750 Sobic003G375500--Sobic003G232600 Sobic003G375500--Sobic009G026600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G174500--Sobic001G261452 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic003G174500--Sobic010G129100 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic010G133450 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic005G068000 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic003G174500--Sobic009G088300 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic009G186300 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic003G174500--Sobic003G118000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic003G174500--Sobic002G181066
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.