Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G261452.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JRS6 , A0A109NDL2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g23004.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G174500 - -
2 Sobic.003G069601 - -
3 Sobic.010G129100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.003G118000 - -
5 Sobic.009G235400 - -
6 Sobic.002G127300 - -
7 Sobic.004G072201 - -
8 Sobic.009G088300 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
9 Sobic.005G068000 expressed protein -
10 Sobic.010G133450 - -
11 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.008G046700 nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G181500 - -
14 Sobic.001G442000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K14379: tartrate-resistant acid phosphatase type 5
15 Sobic.006G255200 - -
16 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -
17 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.007G183600 expressed protein -
19 Sobic.004G127600 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
20 Sobic.003G263900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic001G261452--Sobic003G174500 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic001G261452--Sobic003G069601 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic001G261452--Sobic010G129100 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic001G261452--Sobic003G118000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic001G261452--Sobic009G235400 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic001G261452--Sobic002G127300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G261452--Sobic004G072201 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G261452--Sobic009G088300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G261452--Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic001G261452 Sobic003G174500--Sobic010G129100 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic009G088300 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic003G118000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic003G174500--Sobic002G181066 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic003G069601--Sobic007G183600 Sobic003G069601--Sobic001G261452 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic003G069601--Sobic002G374000 Sobic003G069601--Sobic004G072201 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G069601--Sobic008G046700 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic003G069601--Sobic006G045601 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic003G069601--Sobic006G255200 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic003G069601--Sobic001G442000 Sobic003G069601--Sobic002G127300 Sobic010G129100--Sobic003G174500 Sobic010G129100--Sobic009G088300 Sobic010G129100--Sobic001G261452 Sobic010G129100--Sobic002G127300 Sobic010G129100--Sobic010G133450 Sobic010G129100--Sobic001G442000 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic006G255200 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic010G129100--Sobic001G370800 Sobic003G118000--Sobic001G261452 Sobic003G118000--Sobic003G174500 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G118000--Sobic008G111150 Sobic003G118000--Sobic009G235400 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic003G118000--Sobic001G187900 Sobic003G118000--Sobic009G186300 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G118000--Sobic005G118800 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic003G118000--Sobic001G100300 Sobic003G118000--Sobic010G129100 Sobic009G235400--Sobic006G045601 Sobic009G235400--Sobic001G100300 Sobic009G235400--Sobic003G174500 Sobic009G235400--Sobic001G261452 Sobic009G235400--Sobic009G186300 Sobic009G235400--Sobic005G118800 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic009G235400--Sobic004G093700 Sobic009G235400--Sobic010G129100 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic009G235400--Sobic010G195000 Sobic002G127300--Sobic006G255200 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G127300--Sobic002G309300 Sobic002G127300--Sobic010G129100 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G127300--Sobic004G218400 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic002G127300--Sobic001G038700 Sobic002G127300--Sobic001G442000 Sobic002G127300--Sobic001G370800 Sobic002G127300--Sobic001G261452 Sobic002G127300--Sobic009G088300 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic004G072201--Sobic001G383200 Sobic004G072201--Sobic002G374000 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic001G038700 Sobic004G072201--Sobic001G442000 Sobic004G072201--Sobic006G255200 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic004G072201--Sobic003G263900 Sobic004G072201--Sobic007G183600 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G088300--Sobic001G424650 Sobic009G088300--Sobic010G129100 Sobic009G088300--Sobic001G370800 Sobic009G088300--Sobic001G442000 Sobic009G088300--Sobic006G255200 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic009G088300--Sobic001G492400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G088300--Sobic001G334400 Sobic009G088300--Sobic003G263900 Sobic002G262850 Sobic002G262850 Sobic009G088300--Sobic002G262850 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G174500
Octagon: transcription factors


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