Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G118000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2P6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G261452 - -
2 Sobic.003G174500 - -
3 Sobic.008G111150 - -
4 Sobic.009G235400 - -
5 Sobic.001G187900 disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
7 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G100300 - -
9 Sobic.010G129100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.005G068000 expressed protein -
11 Sobic.003G069601 - -
12 Sobic.010G133450 - -
13 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G072201 - -
15 Sobic.001G524750 - -
16 Sobic.003G358150 - -
17 Sobic.003G210500 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G074601 - -
19 Sobic.007G075600 pectinesterase, putative, expressed -
20 Sobic.006G054200 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@multidrug resistance-associated protein 9("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@multidrug resistance-associated protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G118000--Sobic001G261452 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic003G118000--Sobic003G174500 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G118000--Sobic008G111150 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic003G118000--Sobic009G235400 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic003G118000--Sobic001G187900 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G118000--Sobic009G186300 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G118000--Sobic005G118800 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic003G118000--Sobic001G100300 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic003G118000--Sobic010G129100 Sobic001G261452--Sobic003G174500 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic001G261452--Sobic003G069601 Sobic001G261452--Sobic010G129100 Sobic001G261452--Sobic003G118000 Sobic001G261452--Sobic009G235400 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic001G261452--Sobic002G127300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G261452--Sobic004G072201 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G261452--Sobic009G088300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G261452--Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic001G261452 Sobic003G174500--Sobic010G129100 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic010G133450 Sobic003G174500--Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic009G088300 Sobic003G174500--Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic003G118000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic003G174500--Sobic002G181066 Sobic008G111150--Sobic003G118000 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic008G111150--Sobic004G212250 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic008G111150--Sobic003G177350 Sobic001G524750 Sobic001G524750 Sobic008G111150--Sobic001G524750 Sobic008G111150--Sobic009G186300 Sobic008G111150--Sobic001G261452 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic008G111150--Sobic003G210500 Sobic002G228300 Sobic002G228300 Sobic008G111150--Sobic002G228300 Sobic008G111150--Sobic003G174500 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic009G235400--Sobic006G045601 Sobic009G235400--Sobic001G100300 Sobic009G235400--Sobic003G174500 Sobic009G235400--Sobic001G261452 Sobic009G235400--Sobic009G186300 Sobic009G235400--Sobic005G118800 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic009G235400--Sobic004G093700 Sobic009G235400--Sobic010G129100 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic009G235400--Sobic010G195000 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic001G187900--Sobic002G086900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic001G187900--Sobic007G149500 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic001G187900--Sobic002G208700 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic001G187900--Sobic007G137100 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic001G187900--Sobic006G215650 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic001G187900--Sobic010G042300 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic001G187900--Sobic002G046150 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic001G187900--Sobic006G165501 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic001G187900--Sobic003G329300 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G186300--Sobic001G001800 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic009G186300--Sobic001G038700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic009G186300--Sobic001G460900 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic009G186300--Sobic009G094200 Sobic003G058300 Sobic003G058300 Sobic009G186300--Sobic003G058300 Sobic009G186300--Sobic004G072201 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic009G186300--Sobic005G027350 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic009G186300--Sobic002G309300 Sobic009G186300--Sobic005G068000 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic005G118800--Sobic008G132500 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic005G118800--Sobic004G209100 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic005G118800--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic005G118800--Sobic002G009000 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic005G118800--Sobic001G250750 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G118800--Sobic003G312900 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic005G118800--Sobic003G219300 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic005G118800--Sobic006G072701 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic005G118800--Sobic003G232600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic001G100300--Sobic009G173700 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic001G100300--Sobic010G100600 Sobic001G100300--Sobic009G235400 Sobic001G100300--Sobic010G235100 Sobic001G100300--Sobic007G149500 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic001G100300--Sobic006G235801 Sobic001G100300--Sobic006G045601 Sobic001G100300--Sobic005G118800 Sobic006G121950 Sobic006G121950 Sobic001G100300--Sobic006G121950 Sobic010G129100--Sobic003G174500 Sobic010G129100--Sobic009G088300 Sobic010G129100--Sobic001G261452 Sobic010G129100--Sobic002G127300 Sobic010G129100--Sobic010G133450 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic010G129100--Sobic001G442000 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic004G127600 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic010G129100--Sobic006G255200 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic010G129100--Sobic001G370800
Octagon: transcription factors


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