Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G358150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0I3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G329300 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.007G137100 - -
3 Sobic.008G085800 - -
4 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G053300 mla1, putative, expressed -
6 Sobic.006G223101 - -
7 Sobic.001G229850 - -
8 Sobic.002G171901 - -
9 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G274700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@receptor kinase, putative, expressed -
11 Sobic.005G180850 - -
12 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
13 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G038100 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
16 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
17 Sobic.009G176100 - -
18 Sobic.003G413700 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
19 Sobic.004G117850 - -
20 Sobic.006G223601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G358150--Sobic003G329300 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G358150--Sobic007G137100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G358150--Sobic008G085800 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G358150--Sobic005G118800 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic003G358150--Sobic002G053300 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic003G358150--Sobic006G223101 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G358150--Sobic001G229850 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G358150--Sobic002G171901 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G358150--Sobic010G235100 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic007G137100--Sobic003G329300 Sobic007G137100--Sobic005G182100 Sobic007G137100--Sobic008G085800 Sobic007G137100--Sobic002G171901 Sobic007G137100--Sobic003G358150 Sobic007G137100--Sobic007G174500 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G137100--Sobic003G399200 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G137100--Sobic003G335000 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G137100--Sobic004G118300 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic005G118800--Sobic008G132500 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic005G118800--Sobic004G209100 Sobic005G118800--Sobic010G235100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic005G118800--Sobic002G009000 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic005G118800--Sobic001G250750 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G118800--Sobic003G312900 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic005G118800--Sobic003G219300 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic005G118800--Sobic006G072701 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic005G118800--Sobic003G232600 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic002G053300--Sobic001G431600 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic002G053300--Sobic006G052250 Sobic002G053300--Sobic001G229850 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic002G053300--Sobic001G036400 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G053300--Sobic002G074900 Sobic002G053300--Sobic006G223101 Sobic002G053300--Sobic003G335100 Sobic002G053300--Sobic003G358150 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G053300--Sobic002G256250 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic006G223101--Sobic001G431600 Sobic001G229850--Sobic003G312900 Sobic001G229850--Sobic006G223101 Sobic001G229850--Sobic002G074900 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic001G229850--Sobic006G258100 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G229850--Sobic003G069400 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G229850--Sobic006G048400 Sobic001G229850--Sobic003G335000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic003G335100 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic002G171901--Sobic004G084600 Sobic002G171901--Sobic003G334400 Sobic002G171901--Sobic008G085800 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic002G171901--Sobic007G203800 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic002G171901--Sobic004G117850 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G041200 Sobic002G171901--Sobic006G072701 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G171901--Sobic006G111000 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic002G171901--Sobic010G163666 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G235100--Sobic005G090800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.