Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G180850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJH0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G312900 - -
2 Sobic.004G209100 GRAM domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G373850 - -
5 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
6 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
7 Sobic.006G265500 - -
8 Sobic.003G312800 - -
9 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
10 Sobic.006G052250 - -
11 Sobic.001G229850 - -
12 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
14 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G009000 - -
16 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
17 Sobic.002G067900 - -
18 Sobic.001G250750 - -
19 Sobic.001G340100 - -
20 Sobic.007G078700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G180850--Sobic003G312900 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic005G180850--Sobic004G209100 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic005G180850--Sobic010G235100 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic005G180850--Sobic001G373850 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic005G180850--Sobic008G132500 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic005G180850--Sobic002G074900 Sobic006G265500 Sobic006G265500 Sobic005G180850--Sobic006G265500 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G180850--Sobic003G312800 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic005G180850--Sobic001G226401 Sobic003G312900--Sobic003G312800 Sobic003G312900--Sobic004G209100 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic001G229850 Sobic003G312900--Sobic005G180850 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312900--Sobic001G190900 Sobic003G312900--Sobic008G132500 Sobic003G312900--Sobic001G226401 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G312900--Sobic005G118800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G312900--Sobic003G232600 Sobic004G209100--Sobic008G132500 Sobic004G209100--Sobic003G312900 Sobic004G209100--Sobic005G118800 Sobic004G209100--Sobic005G180850 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic004G209100--Sobic006G145300 Sobic004G209100--Sobic010G235100 Sobic004G209100--Sobic003G232600 Sobic004G209100--Sobic003G312800 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic004G209100--Sobic005G090800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G373850--Sobic002G214000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G373850--Sobic001G202450 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G373850--Sobic003G208200 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G373850--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G373850--Sobic009G077000 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G373850--Sobic008G100201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G373850--Sobic009G257000 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G373850--Sobic004G115100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G373850--Sobic004G133201 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G232600 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic009G074000 Sobic009G074000 Sobic006G265500--Sobic009G074000 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic006G265500--Sobic009G213150 Sobic006G265500--Sobic005G180850 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic006G265500--Sobic008G129500 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic006G265500--Sobic006G149900 Sobic001G162600 Sobic001G162600 Sobic006G265500--Sobic001G162600 Sobic006G265500--Sobic001G340100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic006G265500--Sobic004G127350 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic006G265500--Sobic007G179266 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic003G312800--Sobic005G027350 Sobic001G226401--Sobic005G090800 Sobic001G226401--Sobic002G074900 Sobic001G226401--Sobic002G009000 Sobic001G226401--Sobic003G312900 Sobic001G226401--Sobic008G132500 Sobic001G226401--Sobic002G067900 Sobic001G226401--Sobic009G210250 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic001G226401--Sobic001G016050 Sobic001G226401--Sobic001G250750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.