Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G229850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JRR4 , C6JRQ8 , C6JRY3 , C6JRL6 , C6JRV9 , C6JRR9 , C6JRI4 , C6JRL7 , A0A1Z5S6Z2 , C6JRQ9 , C6JRY2
Pfam PF02689 PF14214 PF05970
Panther DB PTHR10492 PTHR10492:SF35
NCBI CDD KOG0987; DNA helicase PIF1/RRM3
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding GO:0004386helicase activity GO:0006281DNA repair GO:0003678DNA helicase activity GO:0000723telomere maintenance


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51700 : PIF1 helicase
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44786.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G312900 - -
2 Sobic.006G223101 - -
3 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
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12 Sobic.002G067900 - -
13 Sobic.002G171901 - -
14 Sobic.010G163666 - -
15 Sobic.001G226401 - K06995: uncharacterized protein
16 Sobic.006G223601 - -
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18 Sobic.003G312800 - -
19 Sobic.002G009000 - -
20 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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