Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G053300.2
Synonym
Functional annotation mla1, putative, expressed
UniProt A0A1W0W2A7
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF488
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46530 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g41900.1 : mla1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G431600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.006G052250 - -
3 Sobic.001G229850 - -
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11 Sobic.009G011050 - -
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13 Sobic.006G261650 - -
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15 Sobic.006G258100 - -
16 Sobic.005G180850 - -
17 Sobic.008G085800 - -
18 Sobic.007G190466 - -
19 Sobic.003G388201 - -
20 Sobic.003G169550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic002G053300--Sobic001G431600 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic002G053300--Sobic006G052250 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic002G053300--Sobic001G229850 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic002G053300--Sobic001G036400 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G053300--Sobic002G074900 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G053300--Sobic006G223101 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G053300--Sobic003G335100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic002G053300--Sobic003G358150 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G053300--Sobic002G256250 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G431600--Sobic007G004400 Sobic001G431600--Sobic006G223101 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic003G335100 Sobic001G431600--Sobic002G074900 Sobic001G431600--Sobic002G053300 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G431600--Sobic007G190466 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic001G431600--Sobic004G138100 Sobic001G431600--Sobic002G256250 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic006G052250--Sobic007G078700 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic006G052250--Sobic001G136850 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic006G052250--Sobic006G146700 Sobic006G052250--Sobic002G074900 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic006G052250--Sobic005G019250 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic006G052250--Sobic001G202450 Sobic006G052250--Sobic007G190466 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic006G052250--Sobic003G163000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic006G052250--Sobic005G180850 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic001G229850--Sobic003G312900 Sobic001G229850--Sobic006G223101 Sobic001G229850--Sobic002G074900 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic001G229850--Sobic006G258100 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G229850--Sobic003G069400 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G229850--Sobic006G048400 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic001G229850--Sobic003G335000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic003G335100 Sobic006G128150 Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic006G128150 Sobic001G036400--Sobic002G256250 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G036400--Sobic010G265400 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic010G155000 Sobic001G036400--Sobic001G431600 Sobic001G378900 Sobic001G378900 Sobic001G036400--Sobic001G378900 Sobic001G036400--Sobic002G053300 Sobic010G028333 Sobic010G028333 Sobic001G036400--Sobic010G028333 Sobic001G036400--Sobic007G190466 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic006G223101--Sobic001G431600 Sobic003G335100--Sobic007G004400 Sobic003G335100--Sobic006G223601 Sobic003G335100--Sobic006G223101 Sobic003G335100--Sobic003G406850 Sobic003G335100--Sobic003G112100 Sobic003G335100--Sobic002G074900 Sobic003G335100--Sobic008G115200 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G335100--Sobic006G176900 Sobic003G335100--Sobic008G119600 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G358150--Sobic003G329300 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic003G358150--Sobic007G137100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G358150--Sobic008G085800 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G358150--Sobic005G118800 Sobic003G358150--Sobic002G053300 Sobic003G358150--Sobic006G223101 Sobic003G358150--Sobic001G229850 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G358150--Sobic002G171901 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G358150--Sobic010G235100 Sobic002G256250--Sobic002G074900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic003G187600 Sobic002G256250--Sobic010G028333 Sobic002G256250--Sobic007G046700 Sobic002G256250--Sobic008G119600 Sobic002G256250--Sobic006G128150 Sobic002G256250--Sobic007G004400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G256250--Sobic004G274300 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic002G256250--Sobic005G118500
Octagon: transcription factors


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