Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G138100.1
Synonym Sb04g016330
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y113
Pfam -
Panther DB PTHR33349 PTHR33349:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g26390.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031310
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G085800 - -
2 Sobic.004G127766 - -
3 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G431600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.007G190600 - -
6 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
7 Sobic.004G310800 zinc finger protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G154450 - -
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13 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.006G176900 - -
16 Sobic.010G155000 NAC domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G149000 - -
18 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
19 Sobic.003G029150 - -
20 Sobic.004G143550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G138100--Sobic008G085800 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic004G127766 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic004G138100--Sobic005G231000 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic004G138100--Sobic001G431600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic004G138100--Sobic007G190600 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G138100--Sobic007G174500 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic004G138100--Sobic004G310800 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G138100--Sobic002G154450 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic004G138100--Sobic010G254401 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G127766--Sobic004G133201 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G127766--Sobic001G420150 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G127766--Sobic004G276600 Sobic004G127766--Sobic007G190600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic004G127766--Sobic004G129400 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic004G127766--Sobic002G142950 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G127766--Sobic008G100900 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G127766--Sobic006G176900 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G127766--Sobic008G115200 SobicK043700 SobicK043700 Sobic005G231000--SobicK043700 Sobic005G231000--Sobic010G254401 Sobic005G231000--Sobic004G138100 Sobic005G231000--Sobic004G310800 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic002G142950 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic005G231000--Sobic001G521800 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic005G231000--Sobic010G155000 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G231000--Sobic004G180950 Sobic001G431600--Sobic007G004400 Sobic001G431600--Sobic006G223101 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic008G119600 Sobic001G431600--Sobic003G335100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic001G431600--Sobic002G074900 Sobic002G053300 Sobic002G053300 Sobic001G431600--Sobic002G053300 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G431600--Sobic007G190466 Sobic001G431600--Sobic004G138100 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic001G431600--Sobic002G256250 Sobic007G190600--Sobic007G190466 Sobic007G190600--Sobic004G276600 Sobic007G190600--Sobic004G127766 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic007G190600--Sobic005G154600 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic007G190600--Sobic006G261650 Sobic007G190600--Sobic001G420150 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic007G190600--Sobic002G246100 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G190600--Sobic006G059150 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic007G190600--Sobic004G332200 Sobic007G174500--Sobic008G085800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G174500--Sobic010G142501 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic010G274700 Sobic007G174500--Sobic003G329300 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic007G174500--Sobic002G375500 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic002G208500 Sobic007G174500--Sobic004G138100 Sobic007G174500--Sobic001G431600 Sobic007G174500--Sobic005G231000 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G310800--Sobic006G107766 Sobic004G310800--Sobic008G119600 Sobic004G310800--Sobic004G133201 Sobic004G310800--Sobic004G127766 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G310800--Sobic007G046700 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G310800--Sobic003G187600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G310800--Sobic006G035350 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic004G310800--Sobic003G029150 Sobic004G310800--Sobic002G142950 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic002G154450--Sobic010G052100 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic002G154450--Sobic004G127733 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic002G154450--Sobic007G127200 Sobic002G154450--Sobic006G176900 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic002G154450--Sobic001G045900 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic002G154450--Sobic003G251000 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic002G154450--Sobic006G149900 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic002G154450--Sobic010G149000 Sobic002G154450--Sobic005G154600 Sobic010G254401--Sobic005G231000 Sobic010G254401--Sobic003G029150 Sobic010G254401--Sobic010G155000 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic010G254401--Sobic002G202350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic010G254401--Sobic009G094100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G254401--Sobic004G127350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G254401--Sobic007G103200 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic010G254401--Sobic004G072600 Sobic010G254401--Sobic008G119600
Octagon: transcription factors


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