Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G310800.1
Synonym Sb04g034310
Functional annotation zinc finger protein, putative, expressed
UniProt C5XSW6
Pfam -
Panther DB PTHR33826 PTHR33826:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10790 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g52910.1 : zinc finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022239
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G107766 - -
2 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
3 Sobic.004G133201 - -
4 Sobic.004G127766 - -
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7 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
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13 Sobic.006G176900 - -
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16 Sobic.004G127733 - -
17 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
18 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G394701 - -
20 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G310800--Sobic006G107766 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic004G310800--Sobic008G119600 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G310800--Sobic004G133201 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic004G310800--Sobic004G127766 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G310800--Sobic007G046700 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G310800--Sobic003G187600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G310800--Sobic006G035350 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic004G310800--Sobic003G029150 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic004G310800--Sobic002G142950 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic008G119600--Sobic010G132400 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G133201--Sobic007G090433 Sobic004G127766--Sobic004G133201 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G127766--Sobic001G420150 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G127766--Sobic004G276600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic004G127766--Sobic007G190600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic004G127766--Sobic004G129400 Sobic004G127766--Sobic002G142950 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic004G127766--Sobic008G100900 Sobic004G127766--Sobic006G176900 Sobic004G127766--Sobic008G115200 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300 Sobic003G187600--Sobic004G274300 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic004G134400 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic006G107766 Sobic003G187600--Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G260500 Sobic003G187600--Sobic007G046700 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic003G187600--Sobic007G127200 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic006G035350--Sobic008G093300 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G035350--Sobic004G127733 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic003G260500 Sobic006G035350--Sobic004G115100 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic006G035350--Sobic010G143700 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G127200 Sobic003G029150--Sobic003G187600 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic003G029150--Sobic001G045900 Sobic003G029150--Sobic004G127733 Sobic003G029150--Sobic006G176900 Sobic003G029150--Sobic007G103200 Sobic003G029150--Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic008G119600 Sobic003G029150--Sobic006G107766 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic003G029150--Sobic001G045100 Sobic002G142950--Sobic008G100900 Sobic002G142950--Sobic004G133201 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic002G142950--Sobic007G113000 Sobic001G431900 Sobic001G431900 Sobic002G142950--Sobic001G431900 Sobic002G142950--Sobic004G134400 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic004G127766 Sobic002G142950--Sobic010G247750 Sobic002G142950--Sobic004G274300
Octagon: transcription factors


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