Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G231000.1
Synonym Sb05g027830
Functional annotation GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PU86
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF27
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47870.1 : GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029076 , Zm00025a004272
Brachypodium KQJ87063 , KQK10137 , KQJ86191
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K043700 - -
2 Sobic.010G254401 - -
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18 Sobic.003G368550 - -
19 Sobic.004G072600 - -
20 Sobic.002G212900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G231000 Sobic005G231000 SobicK043700 SobicK043700 Sobic005G231000--SobicK043700 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic005G231000--Sobic010G254401 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic005G231000--Sobic004G138100 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic005G231000--Sobic004G310800 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic001G499350 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic005G231000--Sobic002G142950 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic005G231000--Sobic001G521800 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic005G231000--Sobic010G155000 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G231000--Sobic004G180950 SobicK043700--Sobic005G231000 Sobic004G103200 Sobic004G103200 SobicK043700--Sobic004G103200 SobicK043700--Sobic001G499350 SobicK043700--Sobic001G521800 SobicK043700--Sobic002G142950 Sobic003G368550 Sobic003G368550 SobicK043700--Sobic003G368550 Sobic002G212900 Sobic002G212900 SobicK043700--Sobic002G212900 SobicK031900 SobicK031900 SobicK043700--SobicK031900 Sobic002G129900 Sobic002G129900 SobicK043700--Sobic002G129900 Sobic010G254401--Sobic005G231000 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic010G254401--Sobic003G029150 Sobic010G254401--Sobic010G155000 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic010G254401--Sobic002G202350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic010G254401--Sobic009G094100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G254401--Sobic004G127350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G254401--Sobic007G103200 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic010G254401--Sobic004G072600 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G254401--Sobic008G119600 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic004G138100--Sobic008G085800 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic004G127766 Sobic004G138100--Sobic005G231000 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic004G138100--Sobic001G431600 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic004G138100--Sobic007G190600 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G138100--Sobic007G174500 Sobic004G138100--Sobic004G310800 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G138100--Sobic002G154450 Sobic004G138100--Sobic010G254401 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G310800--Sobic006G107766 Sobic004G310800--Sobic008G119600 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G310800--Sobic004G133201 Sobic004G310800--Sobic004G127766 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G310800--Sobic007G046700 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G310800--Sobic003G187600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G310800--Sobic006G035350 Sobic004G310800--Sobic003G029150 Sobic004G310800--Sobic002G142950 Sobic001G499350--Sobic004G103200 Sobic001G499350--Sobic002G212900 Sobic001G499350--SobicK043700 Sobic001G499350--Sobic001G521800 Sobic001G499350--Sobic005G231000 Sobic001G499350--Sobic003G368550 Sobic001G499350--Sobic002G129900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G499350--Sobic001G154450 Sobic001G499350--Sobic007G174500 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic002G142950--Sobic008G100900 Sobic002G142950--Sobic004G133201 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic002G142950--Sobic007G113000 Sobic001G431900 Sobic001G431900 Sobic002G142950--Sobic001G431900 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic002G142950--Sobic004G134400 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic004G127766 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic002G142950--Sobic010G247750 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G142950--Sobic004G274300 Sobic001G521800--Sobic001G154450 Sobic001G521800--Sobic003G368550 Sobic001G521800--Sobic001G499350 Sobic001G521800--Sobic005G231000 Sobic001G521800--SobicK043700 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic001G521800--Sobic009G176100 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic001G521800--Sobic003G445750 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic001G521800--Sobic003G399200 Sobic001G521800--Sobic010G254401 Sobic010G155000--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic010G155000--Sobic001G283400 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic010G155000--Sobic009G192400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic010G155000--Sobic002G200400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic010G155000--Sobic009G199750 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic010G155000--Sobic007G206400 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic010G155000--Sobic002G256250 Sobic010G155000--Sobic010G254401 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic010G155000--Sobic006G041200 Sobic004G180950--Sobic009G199750 Sobic004G180950--Sobic002G200400 Sobic004G180950--Sobic001G283400 Sobic004G180950--Sobic002G129900 Sobic004G180950--Sobic010G155000 Sobic004G180950--Sobic007G206400 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic004G180950--Sobic005G018400 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic004G180950--Sobic003G230800 Sobic004G180950--Sobic006G041200
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