Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G368550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0M1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G129500 - -
2 Sobic.009G213150 - -
3 Sobic.001G521800 expressed protein -
4 Sobic.002G129900 - -
5 Sobic.007G023000 expressed protein -
6 Sobic.006G053601 - -
7 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G212900 expressed protein -
9 Sobic.001G154450 - -
10 Sobic.001G499350 - -
11 Sobic.002G000350 - -
12 Sobic.001G081450 - -
13 Sobic.007G179266 - -
14 Sobic.004G180950 - -
15 Sobic.003G085533 - -
16 Sobic.004G103200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G272950 - -
18 Sobic.002G073000 - -
19 Sobic.004G072300 - -
20 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic003G368550--Sobic008G129500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic009G213150 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G368550--Sobic001G521800 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic003G368550--Sobic002G129900 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic003G368550--Sobic007G023000 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic003G368550--Sobic006G053601 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic003G368550--Sobic005G018400 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic003G368550--Sobic002G212900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic003G368550--Sobic001G154450 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic008G129500--Sobic004G072300 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic008G129500--Sobic002G000350 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic008G129500--Sobic001G224500 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic008G129500--Sobic004G310350 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic008G129500--Sobic003G085533 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic008G129500--Sobic002G112500 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic008G129500--Sobic001G497400 Sobic008G129500--Sobic003G368550 Sobic008G129500--Sobic007G023000 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G213150--Sobic002G094000 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic009G213150--Sobic006G094900 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic009G213150--Sobic007G179266 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G213150--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G213150--Sobic003G142500 Sobic009G213150--Sobic003G368550 Sobic009G213150--Sobic008G129500 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic009G213150--Sobic002G121050 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic009G213150--Sobic003G072000 Sobic001G521800--Sobic001G154450 Sobic001G521800--Sobic003G368550 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic001G521800--Sobic001G499350 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic001G521800--Sobic005G231000 SobicK043700 SobicK043700 Sobic001G521800--SobicK043700 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic001G521800--Sobic009G176100 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic001G521800--Sobic003G445750 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic001G521800--Sobic003G399200 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic001G521800--Sobic010G254401 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic005G018400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G129900--Sobic009G199750 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G129900--Sobic001G283400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic003G368550 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G129900--Sobic006G111000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic006G041200 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G129900--Sobic010G155000 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic007G023000--Sobic002G142950 Sobic007G023000--Sobic008G129500 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic007G023000--Sobic007G113000 Sobic007G023000--Sobic003G368550 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic007G023000--Sobic007G115700 Sobic007G023000--Sobic001G224500 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic007G023000--Sobic008G100900 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G023000--Sobic003G260500 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic007G023000--Sobic003G208200 Sobic006G053601--Sobic002G073000 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic006G053601--Sobic010G098800 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic006G053601--Sobic004G223700 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic006G053601--Sobic010G166201 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic006G053601--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic006G053601--Sobic007G045750 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic006G053601--Sobic001G081450 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic006G053601--Sobic003G173200 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic006G053601--Sobic009G148400 Sobic005G018400--Sobic002G129900 Sobic005G018400--Sobic009G199750 Sobic005G018400--Sobic004G180950 Sobic005G018400--Sobic002G200400 Sobic005G018400--Sobic001G283400 Sobic005G018400--Sobic003G368550 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic005G018400--Sobic006G097600 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic005G018400--Sobic003G230800 Sobic005G018400--Sobic008G129500 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic004G310350 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic001G154450--Sobic002G074700 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic001G154450--Sobic002G149600 Sobic001G154450--Sobic002G121050 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic001G154450--Sobic003G172000 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic001G154450--Sobic009G094100 Sobic001G154450--Sobic006G094900 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic001G154450--Sobic004G072600 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic001G154450--Sobic004G127350 Sobic001G154450--Sobic001G521800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.