Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G018400.1
Synonym Sb05g001570
Functional annotation NB-ARC domain containing protein, expressed
UniProt C5Y3M0
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF542
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46710 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g17014.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033354
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G554300 , TraesCS5D02G554900 , TraesCS2B02G011600 , TraesCS2A02G057700 , TraesCS2B02G503900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.007G167600 expressed protein -
20 Sobic.003G085533 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic005G018400--Sobic002G129900 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic005G018400--Sobic009G199750 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G018400--Sobic004G180950 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic005G018400--Sobic002G200400 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic005G018400--Sobic001G283400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic005G018400--Sobic003G368550 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic005G018400--Sobic006G097600 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic005G018400--Sobic003G230800 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic005G018400--Sobic008G129500 Sobic002G129900--Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic005G018400 Sobic002G129900--Sobic009G199750 Sobic002G129900--Sobic001G283400 Sobic002G129900--Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic003G368550 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G129900--Sobic006G111000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic006G041200 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic002G129900--Sobic010G155000 Sobic009G199750--Sobic004G180950 Sobic009G199750--Sobic001G283400 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic009G199750--Sobic007G206400 Sobic009G199750--Sobic002G200400 Sobic009G199750--Sobic005G018400 Sobic009G199750--Sobic002G129900 Sobic009G199750--Sobic010G155000 Sobic009G199750--Sobic006G041200 Sobic009G199750--Sobic003G230800 Sobic004G180950--Sobic009G199750 Sobic004G180950--Sobic002G200400 Sobic004G180950--Sobic001G283400 Sobic004G180950--Sobic002G129900 Sobic004G180950--Sobic010G155000 Sobic004G180950--Sobic007G206400 Sobic004G180950--Sobic005G018400 Sobic004G180950--Sobic003G230800 Sobic004G180950--Sobic006G041200 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic001G283400--Sobic004G180950 Sobic001G283400--Sobic002G200400 Sobic001G283400--Sobic009G199750 Sobic001G283400--Sobic010G155000 Sobic001G283400--Sobic007G206400 Sobic001G283400--Sobic003G230800 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G283400--Sobic009G192400 Sobic001G283400--Sobic006G041200 Sobic001G283400--Sobic002G129900 Sobic003G368550--Sobic008G129500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic009G213150 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G368550--Sobic001G521800 Sobic003G368550--Sobic002G129900 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic003G368550--Sobic007G023000 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic003G368550--Sobic006G053601 Sobic003G368550--Sobic005G018400 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic003G368550--Sobic002G212900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic003G368550--Sobic001G154450 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic006G097600--Sobic001G471050 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G097600--Sobic007G042700 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic006G097600--Sobic003G129700 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic006G097600--Sobic009G145200 Sobic006G097600--Sobic005G018400 Sobic006G097600--Sobic006G053601 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic006G097600--Sobic002G178900 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic006G097600--Sobic009G170050 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic006G097600--Sobic007G226900 Sobic003G230800--Sobic004G180950 Sobic003G230800--Sobic001G283400 Sobic004G160750 Sobic004G160750 Sobic003G230800--Sobic004G160750 Sobic003G230800--Sobic002G200400 Sobic003G230800--Sobic009G199750 Sobic003G230800--Sobic002G129900 Sobic003G230800--Sobic003G085533 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic003G230800--Sobic006G215650 Sobic003G230800--Sobic004G072300 Sobic008G129500--Sobic004G072300 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic008G129500--Sobic002G000350 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic008G129500--Sobic001G224500 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic008G129500--Sobic004G310350 Sobic008G129500--Sobic003G085533 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic008G129500--Sobic002G112500 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic008G129500--Sobic001G497400 Sobic008G129500--Sobic003G368550 Sobic008G129500--Sobic007G023000
Octagon: transcription factors


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