Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G230800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q4U5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G180950 - -
2 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -
3 Sobic.004G160750 - -
4 Sobic.002G200400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
5 Sobic.009G199750 - -
6 Sobic.002G129900 - -
7 Sobic.003G085533 - -
8 Sobic.006G215650 - -
9 Sobic.004G072300 - -
10 Sobic.007G206400 - -
11 Sobic.010G155000 NAC domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G202350 - -
14 Sobic.010G219200 - -
15 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G247200 - -
17 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
18 Sobic.008G129500 - -
19 Sobic.002G046150 - -
20 Sobic.008G082550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic003G230800--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic003G230800--Sobic001G283400 Sobic004G160750 Sobic004G160750 Sobic003G230800--Sobic004G160750 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic003G230800--Sobic002G200400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic003G230800--Sobic009G199750 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic003G230800--Sobic002G129900 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic003G230800--Sobic003G085533 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic003G230800--Sobic006G215650 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic003G230800--Sobic004G072300 Sobic004G180950--Sobic009G199750 Sobic004G180950--Sobic002G200400 Sobic004G180950--Sobic001G283400 Sobic004G180950--Sobic002G129900 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic004G180950--Sobic010G155000 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic004G180950--Sobic007G206400 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic004G180950--Sobic005G018400 Sobic004G180950--Sobic003G230800 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G180950--Sobic006G041200 Sobic001G283400--Sobic004G180950 Sobic001G283400--Sobic002G200400 Sobic001G283400--Sobic009G199750 Sobic001G283400--Sobic010G155000 Sobic001G283400--Sobic007G206400 Sobic001G283400--Sobic003G230800 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic001G283400--Sobic009G192400 Sobic001G283400--Sobic006G041200 Sobic001G283400--Sobic002G129900 Sobic004G160750--Sobic003G230800 Sobic004G160750--Sobic004G180950 Sobic003G272000 Sobic003G272000 Sobic004G160750--Sobic003G272000 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic004G160750--Sobic010G235100 Sobic004G160750--Sobic004G072300 Sobic004G160750--Sobic005G018400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G160750--Sobic010G219200 Sobic004G160750--Sobic002G200400 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic004G160750--Sobic001G250750 Sobic002G200400--Sobic004G180950 Sobic002G200400--Sobic001G283400 Sobic002G200400--Sobic009G199750 Sobic002G200400--Sobic010G155000 Sobic002G200400--Sobic004G072300 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic002G200400--Sobic006G205300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic004G183701 Sobic002G200400--Sobic003G085533 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic002G200400--Sobic001G352633 Sobic009G199750--Sobic004G180950 Sobic009G199750--Sobic001G283400 Sobic009G199750--Sobic007G206400 Sobic009G199750--Sobic002G200400 Sobic009G199750--Sobic005G018400 Sobic009G199750--Sobic002G129900 Sobic009G199750--Sobic010G155000 Sobic009G199750--Sobic006G041200 Sobic009G199750--Sobic003G230800 Sobic002G129900--Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic005G018400 Sobic002G129900--Sobic009G199750 Sobic002G129900--Sobic001G283400 Sobic002G129900--Sobic002G200400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic002G129900--Sobic003G368550 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G129900--Sobic006G111000 Sobic002G129900--Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic010G155000 Sobic003G085533--Sobic004G072300 Sobic003G085533--Sobic010G219200 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic003G085533--Sobic002G000350 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic003G085533--Sobic008G129500 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic003G085533--Sobic004G310350 Sobic003G085533--Sobic002G200400 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic003G085533--Sobic001G497400 Sobic003G085533--Sobic004G183701 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic003G085533--Sobic009G247200 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G046150 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic006G215650--Sobic002G208900 Sobic006G215650--Sobic002G129900 Sobic006G215650--Sobic003G230800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic006G215650--Sobic002G208700 Sobic006G215650--Sobic004G180950 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic006G215650--Sobic009G176100 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic005G018400 Sobic004G072300--Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic002G000350 Sobic004G072300--Sobic010G219200 Sobic004G072300--Sobic008G129500 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic004G072300--Sobic002G112500 Sobic004G072300--Sobic002G200400 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic004G183701 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic004G072300--Sobic001G373850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.