Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G247200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YWF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.009G247200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G085533 - -
2 Sobic.004G310350 - -
3 Sobic.005G168200 -(PubMedID : 34525227)@expressed protein K17911: beta-carotene isomerase
4 Sobic.008G129500 - -
5 Sobic.002G212900 expressed protein -
6 Sobic.001G497400 - -
7 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
8 Sobic.002G000350 - -
9 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G208500 glutamate receptor 2.6 precursor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
11 Sobic.004G072300 - -
12 Sobic.010G219200 - -
13 Sobic.003G205000 DUF623 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G046150 - -
15 Sobic.009G213150 - -
16 Sobic.005G019250 - -
17 Sobic.002G129900 - -
18 Sobic.003G230800 - -
19 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
20 Sobic.003G368550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic009G247200--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic009G247200--Sobic004G310350 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic009G247200--Sobic005G168200 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic009G247200--Sobic008G129500 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic009G247200--Sobic002G212900 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic009G247200--Sobic001G497400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G247200--Sobic007G042700 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic009G247200--Sobic002G000350 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic009G247200--Sobic004G252300 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic003G085533--Sobic004G072300 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic003G085533--Sobic010G219200 Sobic003G085533--Sobic002G000350 Sobic003G085533--Sobic008G129500 Sobic003G085533--Sobic004G310350 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic003G085533--Sobic002G200400 Sobic003G085533--Sobic001G497400 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic003G085533--Sobic004G183701 Sobic003G085533--Sobic009G247200 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G310350--Sobic006G053550 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G310350--Sobic005G019250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G310350--Sobic002G214000 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic004G310350--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G310350--SobicK031900 Sobic004G310350--Sobic008G129500 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G310350--Sobic005G154600 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G310350--Sobic009G215100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic004G310350--Sobic003G268100 Sobic005G168200--Sobic009G247200 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic005G168200--Sobic001G145550 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic005G168200--Sobic001G174100 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic005G168200--Sobic002G375500 Sobic001G422001 Sobic001G422001 Sobic005G168200--Sobic001G422001 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic005G168200--Sobic002G046150 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic005G168200--Sobic002G208500 Sobic005G168200--Sobic002G212900 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G168200--Sobic009G213150 Sobic008G129500--Sobic004G072300 Sobic008G129500--Sobic002G000350 Sobic008G129500--Sobic001G224500 Sobic008G129500--Sobic004G310350 Sobic008G129500--Sobic003G085533 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic008G129500--Sobic002G112500 Sobic008G129500--Sobic001G497400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic008G129500--Sobic003G368550 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic008G129500--Sobic007G023000 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic004G310350 Sobic001G497400--Sobic004G252300 Sobic001G497400--Sobic007G042700 Sobic001G497400--Sobic002G000350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G497400--Sobic001G278900 Sobic001G497400--Sobic008G129500 Sobic001G497400--Sobic003G085533 Sobic001G497400--Sobic004G310350 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G497400--Sobic009G077000 Sobic001G497400--Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic001G497400 Sobic007G042700--Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic001G278900 Sobic007G042700--Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic004G252300 Sobic007G042700--Sobic004G072300 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G042700--Sobic001G471050 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G042700--Sobic004G249950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G042700--Sobic006G097600 Sobic002G000350--Sobic004G072300 Sobic002G000350--Sobic002G112500 Sobic002G000350--Sobic003G085533 Sobic002G000350--Sobic008G129500 Sobic002G000350--Sobic001G471050 Sobic002G000350--Sobic007G042700 Sobic002G000350--Sobic001G497400 Sobic002G000350--Sobic010G219200 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G000350--Sobic001G081450 Sobic004G252300--Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic009G077000 Sobic004G252300--Sobic006G053550 Sobic004G252300--Sobic002G214000 Sobic004G252300--Sobic004G310350 Sobic004G252300--Sobic009G215100 Sobic004G252300--SobicK031900 Sobic004G252300--Sobic007G042700 Sobic004G252300--Sobic010G219200
Octagon: transcription factors


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