Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G019250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG68
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G310350 - -
2 Sobic.001G202450 - -
3 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
4 Sobic.006G053550 - -
5 Sobic.001G373850 - -
6 Sobic.009G077000 - -
7 Sobic.005G045250 - -
8 Sobic.003G163000 - -
9 Sobic.001G497400 - -
10 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G129500 - -
12 Sobic.003G085533 - -
13 Sobic.K031900 - -
14 Sobic.001G224500 - -
15 Sobic.010G219200 - -
16 Sobic.006G052250 - -
17 Sobic.008G100201 - -
18 Sobic.003G208200 - -
19 Sobic.005G154600 - -
20 Sobic.004G332200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic005G019250--Sobic004G310350 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic005G019250--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic005G019250--Sobic002G214000 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic005G019250--Sobic006G053550 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic005G019250--Sobic001G373850 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic005G019250--Sobic009G077000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic005G019250--Sobic005G045250 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic005G019250--Sobic003G163000 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic005G019250--Sobic001G497400 Sobic004G310350--Sobic006G053550 Sobic004G310350--Sobic005G019250 Sobic004G310350--Sobic002G214000 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic004G310350--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G310350--SobicK031900 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G310350--Sobic008G129500 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G310350--Sobic005G154600 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G310350--Sobic009G215100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic004G310350--Sobic003G268100 Sobic001G202450--Sobic001G373850 Sobic001G202450--Sobic009G077000 Sobic001G202450--Sobic005G045250 Sobic001G202450--Sobic002G214000 Sobic001G202450--Sobic005G019250 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G202450--Sobic009G210250 Sobic001G202450--Sobic003G163000 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G202450--Sobic003G208200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G202450--Sobic004G332200 Sobic002G214000--Sobic001G373850 Sobic002G214000--Sobic009G077000 Sobic002G214000--Sobic001G202450 Sobic002G214000--Sobic004G310350 Sobic002G214000--SobicK031900 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic002G214000--Sobic008G100201 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic002G214000--Sobic007G200700 Sobic002G214000--Sobic005G019250 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G214000--Sobic010G219200 Sobic006G053550--Sobic009G215100 Sobic006G053550--Sobic004G310350 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic001G224500 SobicK031400 SobicK031400 Sobic006G053550--SobicK031400 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic006G053550--Sobic003G173200 Sobic006G053550--SobicK031900 Sobic006G053550--Sobic003G268100 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic006G053550--Sobic002G334700 Sobic001G373850--Sobic002G214000 Sobic001G373850--Sobic001G202450 Sobic001G373850--Sobic003G208200 Sobic001G373850--Sobic009G210250 Sobic001G373850--Sobic009G077000 Sobic001G373850--Sobic008G100201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G373850--Sobic009G257000 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G373850--Sobic004G115100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G373850--Sobic004G133201 Sobic009G077000--Sobic002G214000 Sobic009G077000--Sobic001G202450 Sobic009G077000--Sobic005G045250 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic009G077000--Sobic001G107550 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic009G077000--Sobic003G161900 Sobic009G077000--Sobic001G373850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic009G077000--Sobic002G401533 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic009G077000--Sobic001G261444 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic009G077000--Sobic006G107700 Sobic005G045250--Sobic001G202450 Sobic005G045250--Sobic009G077000 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic005G045250--Sobic003G030450 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic005G045250--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic001G502801 Sobic005G045250--Sobic002G214000 Sobic005G045250--Sobic003G161900 Sobic005G045250--Sobic002G401533 Sobic005G045250--Sobic005G019250 Sobic003G163000--Sobic001G202450 Sobic003G163000--Sobic002G214000 Sobic003G163000--Sobic001G373850 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic003G163000--Sobic003G169700 Sobic003G163000--Sobic004G332200 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic005G045250 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G163000--Sobic004G276600 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic003G163000--Sobic004G303900 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic001G497400--Sobic004G252300 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G497400--Sobic007G042700 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic001G497400--Sobic002G000350 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic001G497400--Sobic001G278900 Sobic001G497400--Sobic008G129500 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic001G497400--Sobic003G085533 Sobic001G497400--Sobic004G310350 Sobic001G497400--Sobic009G077000 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic001G497400--Sobic004G072300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.