Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G212900.2
Synonym Sb02g025555
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W5E9
Pfam -
Panther DB PTHR23273 PTHR23273:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g32310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G103200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G136700 - -
3 Sobic.001G499350 - -
4 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
5 Sobic.010G219200 - -
6 Sobic.003G368550 - -
7 Sobic.009G247200 - -
8 Sobic.003G085533 - -
9 Sobic.004G310350 - -
10 Sobic.006G111000 expressed protein -
11 Sobic.003G272000 expressed protein -
12 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
13 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G100900 - -
15 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
16 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G134800 - -
19 Sobic.004G183701 - -
20 Sobic.004G180950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic002G212900--Sobic004G310350 Sobic004G103200--Sobic001G499350 Sobic004G103200--Sobic002G212900 SobicK043700 SobicK043700 Sobic004G103200--SobicK043700 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic004G103200--Sobic002G129900 Sobic004G103200--Sobic003G368550 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic004G103200--Sobic005G231000 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic004G103200--Sobic004G252300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G103200--Sobic004G183701 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic004G103200--Sobic007G056300 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G136700--Sobic008G119600 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic010G132400 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic010G136700--Sobic008G115200 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic006G107766 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic010G136700--Sobic007G004400 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic010G136700--Sobic007G090433 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G136700--Sobic005G090800 Sobic010G136700--Sobic002G212900 Sobic001G499350--Sobic004G103200 Sobic001G499350--Sobic002G212900 Sobic001G499350--SobicK043700 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic001G499350--Sobic001G521800 Sobic001G499350--Sobic005G231000 Sobic001G499350--Sobic003G368550 Sobic001G499350--Sobic002G129900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G499350--Sobic001G154450 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic001G499350--Sobic007G174500 Sobic010G132400--Sobic010G136700 Sobic010G132400--Sobic008G119600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic010G132400--Sobic006G035350 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic010G132400--Sobic005G154600 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic006G176900 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic010G132400--Sobic004G276600 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G132400--Sobic004G127733 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic008G115200 Sobic010G219200--Sobic003G085533 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G219200--Sobic004G072300 Sobic010G219200--Sobic004G183701 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic010G219200--Sobic007G116150 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic010G219200--Sobic008G100201 SobicK031900 SobicK031900 Sobic010G219200--SobicK031900 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic010G219200--Sobic002G112500 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic010G219200--Sobic010G143700 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic010G219200--Sobic001G383350 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic003G368550--Sobic008G129500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic001G521800 Sobic003G368550--Sobic002G129900 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic003G368550--Sobic007G023000 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic003G368550--Sobic006G053601 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic003G368550--Sobic005G018400 Sobic003G368550--Sobic002G212900 Sobic003G368550--Sobic001G154450 Sobic009G247200--Sobic003G085533 Sobic009G247200--Sobic004G310350 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic009G247200--Sobic005G168200 Sobic009G247200--Sobic008G129500 Sobic009G247200--Sobic002G212900 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic009G247200--Sobic001G497400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G247200--Sobic007G042700 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic009G247200--Sobic002G000350 Sobic009G247200--Sobic004G252300 Sobic003G085533--Sobic004G072300 Sobic003G085533--Sobic010G219200 Sobic003G085533--Sobic002G000350 Sobic003G085533--Sobic008G129500 Sobic003G085533--Sobic004G310350 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic003G085533--Sobic002G200400 Sobic003G085533--Sobic001G497400 Sobic003G085533--Sobic004G183701 Sobic003G085533--Sobic009G247200 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G310350--Sobic006G053550 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G310350--Sobic005G019250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G310350--Sobic002G214000 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic004G310350--Sobic001G224500 Sobic004G310350--SobicK031900 Sobic004G310350--Sobic008G129500 Sobic004G310350--Sobic005G154600 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G310350--Sobic009G215100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic004G310350--Sobic003G268100
Octagon: transcription factors


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