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Transcriptome id Sobic.K043700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt -
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057772
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G386800 , TraesCS7A02G238100 , TraesCS4D02G138200 , TraesCS4D02G145900 , TraesCS4A02G161500 , TraesCS7D02G285500 , TraesCS1A02G098000 , TraesCS7D02G301600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G103200 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G499350 - -
4 Sobic.001G521800 expressed protein -
5 Sobic.002G142950 - -
6 Sobic.003G368550 - -
7 Sobic.002G212900 expressed protein -
8 Sobic.K031900 - -
9 Sobic.002G129900 - -
10 Sobic.003G268100 - -
11 Sobic.008G100900 - -
12 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
13 Sobic.006G053601 - -
14 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G143700 - -
16 Sobic.007G116150 - -
17 Sobic.006G053550 - -
18 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b
19 Sobic.004G127766 - -
20 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample SobicK043700 SobicK043700 Sobic005G231000 Sobic005G231000 SobicK043700--Sobic005G231000 Sobic004G103200 Sobic004G103200 SobicK043700--Sobic004G103200 Sobic001G499350 Sobic001G499350 SobicK043700--Sobic001G499350 Sobic001G521800 Sobic001G521800 SobicK043700--Sobic001G521800 Sobic002G142950 Sobic002G142950 SobicK043700--Sobic002G142950 Sobic003G368550 Sobic003G368550 SobicK043700--Sobic003G368550 Sobic002G212900 Sobic002G212900 SobicK043700--Sobic002G212900 SobicK031900 SobicK031900 SobicK043700--SobicK031900 Sobic002G129900 Sobic002G129900 SobicK043700--Sobic002G129900 Sobic005G231000--SobicK043700 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic005G231000--Sobic010G254401 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic005G231000--Sobic004G138100 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic005G231000--Sobic004G310800 Sobic005G231000--Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic002G142950 Sobic005G231000--Sobic001G521800 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic005G231000--Sobic010G155000 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G231000--Sobic004G180950 Sobic004G103200--Sobic001G499350 Sobic004G103200--Sobic002G212900 Sobic004G103200--SobicK043700 Sobic004G103200--Sobic002G129900 Sobic004G103200--Sobic003G368550 Sobic004G103200--Sobic005G231000 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic004G103200--Sobic004G252300 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G103200--Sobic004G183701 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic004G103200--Sobic007G056300 Sobic001G499350--Sobic004G103200 Sobic001G499350--Sobic002G212900 Sobic001G499350--SobicK043700 Sobic001G499350--Sobic001G521800 Sobic001G499350--Sobic005G231000 Sobic001G499350--Sobic003G368550 Sobic001G499350--Sobic002G129900 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G499350--Sobic001G154450 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic001G499350--Sobic007G174500 Sobic001G521800--Sobic001G154450 Sobic001G521800--Sobic003G368550 Sobic001G521800--Sobic001G499350 Sobic001G521800--Sobic005G231000 Sobic001G521800--SobicK043700 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic001G521800--Sobic009G176100 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic001G521800--Sobic003G445750 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic001G521800--Sobic003G399200 Sobic001G521800--Sobic010G254401 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic002G142950--Sobic008G100900 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G142950--Sobic004G133201 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic002G142950--Sobic007G113000 Sobic001G431900 Sobic001G431900 Sobic002G142950--Sobic001G431900 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic002G142950--Sobic004G134400 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic007G023000 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic002G142950--Sobic004G127766 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic002G142950--Sobic010G247750 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G142950--Sobic004G274300 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic003G368550--Sobic008G129500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic009G213150 Sobic003G368550--Sobic001G521800 Sobic003G368550--Sobic002G129900 Sobic003G368550--Sobic007G023000 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic003G368550--Sobic006G053601 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic003G368550--Sobic005G018400 Sobic003G368550--Sobic002G212900 Sobic003G368550--Sobic001G154450 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic002G212900--Sobic004G310350 Sobic008G100201 Sobic008G100201 SobicK031900--Sobic008G100201 Sobic010G143700 Sobic010G143700 SobicK031900--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic003G268100 Sobic004G115100 Sobic004G115100 SobicK031900--Sobic004G115100 Sobic007G200700 Sobic007G200700 SobicK031900--Sobic007G200700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK031900--Sobic007G116150 SobicK031400 SobicK031400 SobicK031900--SobicK031400 Sobic006G035350 Sobic006G035350 SobicK031900--Sobic006G035350 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK031900--Sobic001G383350 Sobic002G129900--Sobic004G180950 Sobic002G129900--Sobic005G018400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic002G129900--Sobic009G199750 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic002G129900--Sobic001G283400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic002G200400 Sobic002G129900--Sobic003G368550 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic002G129900--Sobic006G111000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic006G041200 Sobic002G129900--Sobic010G155000
Octagon: transcription factors


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