Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G254401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VUR7
Pfam PF13456
Panther DB PTHR33033 PTHR33033:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G25270 : Ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06215.1 : RNA-directed DNA polymerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G231000 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G029150 - -
3 Sobic.010G155000 NAC domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G202350 - -
5 Sobic.009G094100 - -
6 Sobic.004G127350 - -
7 Sobic.007G103200 - -
8 Sobic.004G072600 - -
9 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
10 Sobic.001G154450 - -
11 Sobic.004G180950 - -
12 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.004G310800 zinc finger protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G256250 - -
15 Sobic.010G247750 - -
16 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
17 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
18 Sobic.004G138100 expressed protein -
19 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G260500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic010G254401--Sobic005G231000 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic010G254401--Sobic003G029150 Sobic010G155000 Sobic010G155000 Sobic010G254401--Sobic010G155000 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic010G254401--Sobic002G202350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic010G254401--Sobic009G094100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G254401--Sobic004G127350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G254401--Sobic007G103200 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic010G254401--Sobic004G072600 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G254401--Sobic008G119600 SobicK043700 SobicK043700 Sobic005G231000--SobicK043700 Sobic005G231000--Sobic010G254401 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic005G231000--Sobic004G138100 Sobic004G310800 Sobic004G310800 Sobic005G231000--Sobic004G310800 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic005G231000--Sobic001G499350 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic005G231000--Sobic002G142950 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic005G231000--Sobic001G521800 Sobic005G231000--Sobic010G155000 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic005G231000--Sobic004G180950 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic003G029150--Sobic003G187600 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic003G029150--Sobic001G045900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic003G029150--Sobic004G127733 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G029150--Sobic006G176900 Sobic003G029150--Sobic007G103200 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic008G119600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G029150--Sobic006G107766 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic003G029150--Sobic001G045100 Sobic010G155000--Sobic004G180950 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic010G155000--Sobic001G283400 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic010G155000--Sobic009G192400 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic010G155000--Sobic002G200400 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic010G155000--Sobic009G199750 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic010G155000--Sobic007G206400 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic010G155000--Sobic002G256250 Sobic010G155000--Sobic010G254401 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic010G155000--Sobic006G041200 Sobic002G202350--Sobic010G254401 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic002G202350--Sobic005G187700 Sobic002G202350--Sobic007G206400 Sobic002G202350--Sobic004G180950 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G202350--Sobic003G230800 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic002G202350--Sobic001G154450 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G202350--Sobic003G028700 Sobic002G202350--Sobic009G199750 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic002G202350--Sobic007G167600 Sobic009G094100--Sobic007G103200 Sobic009G094100--Sobic004G127350 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic009G094100--Sobic010G052100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G094100--Sobic003G268100 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic009G094100--Sobic005G176300 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic009G094100--Sobic010G247750 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G094100--Sobic010G143700 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G094100--Sobic004G130500 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic009G094100--Sobic003G172000 Sobic004G127350--Sobic009G094100 Sobic004G127350--Sobic010G052100 Sobic004G127350--Sobic007G103200 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic004G127350--Sobic006G149900 Sobic004G127350--Sobic010G247750 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G127350--Sobic007G127200 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic004G127350--Sobic010G225175 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G127350--Sobic003G260500 Sobic004G127350--Sobic001G045900 Sobic007G103200--Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic004G127733 Sobic007G103200--Sobic004G130500 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G103200--Sobic006G035350 Sobic007G103200--Sobic010G247750 Sobic007G103200--Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic010G052100 Sobic007G103200--Sobic007G127200 Sobic007G103200--Sobic001G045900 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic004G072600--Sobic002G149600 Sobic004G072600--Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic009G094100 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic004G072600--Sobic002G074700 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic004G072600--Sobic002G163400 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic002G121050 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G172000 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic004G072600--Sobic003G263450 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic008G119600--Sobic010G132400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.