Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G129100.1
Synonym Sb10g011750
Functional annotation aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed
UniProt C5Z1K2
Pfam PF14541
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF367
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10770 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20190.1 : aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G174500 - -
2 Sobic.009G088300 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
3 Sobic.001G261452 - -
4 Sobic.002G127300 - -
5 Sobic.010G133450 - -
6 Sobic.001G442000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K14379: tartrate-resistant acid phosphatase type 5
7 Sobic.004G127600 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
8 Sobic.006G255200 - -
9 Sobic.001G370800 - -
10 Sobic.003G069601 - -
11 Sobic.008G177100 expressed protein -
12 Sobic.009G235400 - -
13 Sobic.003G263900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G410000 expressed protein -
15 Sobic.005G068000 expressed protein -
16 Sobic.001G424650 - -
17 Sobic.004G072201 - -
18 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic010G129100--Sobic003G174500 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic010G129100--Sobic009G088300 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic010G129100--Sobic001G261452 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic010G129100--Sobic002G127300 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic010G129100--Sobic010G133450 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic010G129100--Sobic001G442000 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic010G129100--Sobic004G127600 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic010G129100--Sobic006G255200 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic010G129100--Sobic001G370800 Sobic003G174500--Sobic001G261452 Sobic003G174500--Sobic010G129100 Sobic003G174500--Sobic010G133450 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic003G174500--Sobic009G235400 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic005G068000 Sobic003G174500--Sobic009G088300 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic003G174500--Sobic009G186300 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic003G174500--Sobic003G118000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic003G174500--Sobic002G181066 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G088300--Sobic001G424650 Sobic009G088300--Sobic010G129100 Sobic009G088300--Sobic001G370800 Sobic009G088300--Sobic001G442000 Sobic009G088300--Sobic006G255200 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic009G088300--Sobic001G492400 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G088300--Sobic001G334400 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic009G088300--Sobic003G263900 Sobic002G262850 Sobic002G262850 Sobic009G088300--Sobic002G262850 Sobic001G261452--Sobic003G174500 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic001G261452--Sobic003G069601 Sobic001G261452--Sobic010G129100 Sobic001G261452--Sobic003G118000 Sobic001G261452--Sobic009G235400 Sobic001G261452--Sobic002G127300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G261452--Sobic004G072201 Sobic001G261452--Sobic009G088300 Sobic001G261452--Sobic005G068000 Sobic002G127300--Sobic006G255200 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G127300--Sobic002G309300 Sobic002G127300--Sobic010G129100 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic002G127300--Sobic004G218400 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic002G127300--Sobic001G038700 Sobic002G127300--Sobic001G442000 Sobic002G127300--Sobic001G370800 Sobic002G127300--Sobic001G261452 Sobic002G127300--Sobic009G088300 Sobic010G133450--Sobic003G174500 Sobic010G133450--Sobic010G129100 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic010G133450--Sobic009G094200 Sobic010G133450--Sobic009G088300 Sobic010G133450--Sobic003G263900 Sobic010G133450--Sobic001G261452 Sobic010G133450--Sobic004G127600 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic010G133450--Sobic003G410000 Sobic010G133450--Sobic006G255200 Sobic001G442000--Sobic006G255200 Sobic001G442000--Sobic004G072201 Sobic001G442000--Sobic001G370800 Sobic001G442000--Sobic004G127600 Sobic001G442000--Sobic009G088300 Sobic001G442000--Sobic002G309300 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G442000--Sobic009G026600 Sobic001G442000--Sobic001G038700 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G442000--Sobic002G187900 Sobic004G127600--Sobic002G187900 Sobic004G127600--Sobic003G263900 Sobic004G127600--Sobic006G255200 Sobic004G127600--Sobic001G442000 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic004G127600--Sobic001G212900 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic004G127600--Sobic001G109400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G127600--Sobic002G374000 Sobic004G127600--Sobic004G072201 Sobic004G127600--Sobic001G038700 Sobic006G255200--Sobic002G187900 Sobic006G255200--Sobic003G263900 Sobic006G255200--Sobic002G309300 Sobic006G255200--Sobic001G442000 Sobic006G255200--Sobic004G127600 Sobic006G255200--Sobic004G072201 Sobic006G255200--Sobic001G109400 Sobic006G255200--Sobic004G218400 Sobic006G255200--Sobic001G370800 Sobic001G370800--Sobic009G026600 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic004G173200 Sobic001G370800--Sobic001G038700 Sobic001G370800--Sobic001G442000 Sobic001G370800--Sobic002G309300 Sobic001G370800--Sobic009G088300 Sobic001G370800--Sobic004G218400 Sobic001G370800--Sobic006G255200 Sobic001G370800--Sobic003G263900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.