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Transcriptome id Sobic.001G524750.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SC04
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Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G162600 - -
2 Sobic.005G068000 expressed protein -
3 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G223101 - -
5 Sobic.006G223601 - -
6 Sobic.002G067900 - -
7 Sobic.006G145300 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed -
8 Sobic.001G229850 - -
9 Sobic.001G074601 - -
10 Sobic.003G335000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.003G406850 - -
13 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G248450 - -
15 Sobic.006G121950 - -
16 Sobic.003G232600 polygalacturonase, putative, expressed -
17 Sobic.006G258100 - -
18 Sobic.003G069400 - -
19 Sobic.003G124400 - -
20 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G524750 Sobic001G524750 Sobic001G162600 Sobic001G162600 Sobic001G524750--Sobic001G162600 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G524750--Sobic005G068000 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic001G524750--Sobic003G335100 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic001G524750--Sobic006G223101 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic001G524750--Sobic006G223601 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic001G524750--Sobic002G067900 Sobic006G145300 Sobic006G145300 Sobic001G524750--Sobic006G145300 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic001G524750--Sobic001G229850 Sobic001G074601 Sobic001G074601 Sobic001G524750--Sobic001G074601 Sobic001G162600--Sobic001G524750 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G162600--Sobic007G004400 Sobic001G162600--Sobic002G067900 Sobic001G162600--Sobic003G335100 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic001G162600--Sobic010G235100 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic001G162600--Sobic009G030501 Sobic006G265500 Sobic006G265500 Sobic001G162600--Sobic006G265500 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic001G162600--Sobic006G149900 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic001G162600--Sobic003G072000 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic005G068000--Sobic003G124400 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic005G068000--Sobic001G239000 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic005G068000--Sobic003G312800 Sobic008G037300 Sobic008G037300 Sobic005G068000--Sobic008G037300 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic005G068000--Sobic005G027350 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic005G068000--Sobic003G312900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic005G068000--Sobic002G309300 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic005G068000--Sobic003G375500 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic005G068000--Sobic003G174500 Sobic003G335100--Sobic007G004400 Sobic003G335100--Sobic006G223601 Sobic003G335100--Sobic006G223101 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G335100--Sobic003G406850 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G335100--Sobic003G112100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic003G335100--Sobic002G074900 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic003G335100--Sobic008G115200 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G335100--Sobic006G176900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic003G335100--Sobic008G119600 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G223101--Sobic001G431600 Sobic006G223601--Sobic006G223101 Sobic006G223601--Sobic003G335100 Sobic006G223601--Sobic003G406850 Sobic006G223601--Sobic002G147550 Sobic006G223601--Sobic003G112100 Sobic006G223601--Sobic007G004400 Sobic006G223601--Sobic006G176900 Sobic006G223601--Sobic008G115200 Sobic006G223601--Sobic006G149900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic002G067900--Sobic005G090800 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic002G067900--Sobic003G232600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic001G340100 Sobic002G067900--Sobic007G004400 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic001G400601 Sobic002G067900--Sobic010G235100 Sobic002G067900--Sobic002G074900 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic001G250750 Sobic002G067900--Sobic008G115200 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic006G145300--Sobic004G209100 Sobic006G145300--Sobic006G223101 Sobic006G145300--Sobic008G115200 Sobic006G145300--Sobic005G090800 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic006G145300--Sobic003G251000 Sobic006G145300--Sobic010G235100 Sobic006G145300--Sobic007G004400 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic006G145300--Sobic010G136700 Sobic006G145300--Sobic003G232600 Sobic001G229850--Sobic003G312900 Sobic001G229850--Sobic006G223101 Sobic001G229850--Sobic002G074900 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic001G229850--Sobic006G258100 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic001G229850--Sobic003G069400 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic001G229850--Sobic006G048400 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic001G229850--Sobic003G335000 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic002G181066 Sobic001G229850--Sobic003G335100 Sobic006G117800 Sobic006G117800 Sobic001G074601--Sobic006G117800 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic001G074601--Sobic007G149500 Sobic001G074601--Sobic001G524750 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic001G074601--Sobic002G086900 Sobic001G074601--Sobic006G145300 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic001G074601--Sobic007G133733 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic001G074601--Sobic001G187900 Sobic001G074601--Sobic001G162600 Sobic007G149950 Sobic007G149950 Sobic001G074601--Sobic007G149950
Octagon: transcription factors


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