Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G046700.3
Synonym Sb08g003950
Functional annotation nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PBA0
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF55
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G08250 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g06180.1 : nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025787 , Zm00025a025786
Brachypodium PNT65402
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic008G046700--Sobic003G069601 Sobic004G267650 Sobic004G267650 Sobic008G046700--Sobic004G267650 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic008G046700--Sobic002G181500 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic008G046700--Sobic001G261452 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic008G046700--Sobic007G183600 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic008G046700--Sobic002G046150 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic008G046700--Sobic001G174100 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic008G046700--Sobic004G072201 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic008G046700--Sobic003G433000 Sobic003G069601--Sobic007G183600 Sobic003G069601--Sobic001G261452 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic003G069601--Sobic002G374000 Sobic003G069601--Sobic004G072201 Sobic003G069601--Sobic008G046700 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic003G069601--Sobic006G045601 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic003G069601--Sobic006G255200 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic003G069601--Sobic001G442000 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G069601--Sobic002G127300 Sobic004G267650--Sobic001G174100 Sobic004G267650--Sobic008G046700 Sobic004G267650--Sobic003G433000 Sobic004G267650--Sobic002G046150 Sobic004G267650--Sobic003G069601 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic004G267650--Sobic006G280250 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic004G267650--Sobic010G089350 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G267650--Sobic007G149500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic004G267650--Sobic004G267400 Sobic002G181500--Sobic008G046700 Sobic003G338600 Sobic003G338600 Sobic002G181500--Sobic003G338600 Sobic002G181500--Sobic001G261452 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic002G181500--Sobic002G281850 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G263900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic002G181500--Sobic003G312800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic002G181500--Sobic010G100700 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G181500--Sobic004G209100 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic002G181500--Sobic005G118800 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic001G261452--Sobic003G174500 Sobic001G261452--Sobic003G069601 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic001G261452--Sobic010G129100 Sobic003G118000 Sobic003G118000 Sobic001G261452--Sobic003G118000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic001G261452--Sobic009G235400 Sobic001G261452--Sobic002G127300 Sobic001G261452--Sobic004G072201 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G261452--Sobic009G088300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic001G261452--Sobic005G068000 Sobic007G183600--Sobic003G069601 Sobic007G183600--Sobic004G072201 Sobic007G183600--Sobic002G374000 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic007G183600--Sobic004G093700 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic007G183600--Sobic004G068600 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic007G183600--Sobic001G383200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic007G183600--Sobic003G063400 Sobic007G183600--Sobic001G442000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic007G183600--Sobic009G026600 Sobic002G046150--Sobic007G149500 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic002G046150--Sobic006G215650 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G046150--Sobic009G247200 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G046150--Sobic006G221500 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic002G046150--Sobic002G086900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G046150--Sobic003G230800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic002G046150--Sobic002G208700 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic002G046150--Sobic005G168200 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic002G046150--Sobic009G173700 Sobic001G174100--Sobic005G168200 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic001G174100--Sobic002G375500 Sobic001G174100--Sobic004G267650 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic001G174100--Sobic007G175100 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic001G174100--Sobic007G038100 Sobic001G174100--Sobic002G046150 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic001G174100--Sobic001G145550 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic001G174100--Sobic002G208500 Sobic001G174100--Sobic008G046700 Sobic004G072201--Sobic001G383200 Sobic004G072201--Sobic002G374000 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic001G109400 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic002G309300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic004G072201--Sobic001G038700 Sobic004G072201--Sobic001G442000 Sobic004G072201--Sobic006G255200 Sobic004G072201--Sobic003G263900 Sobic004G072201--Sobic007G183600 Sobic003G433000--Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic003G069601 Sobic003G433000--Sobic008G046700 Sobic003G433000--Sobic006G280250 Sobic003G433000--Sobic001G174100 Sobic003G433000--Sobic002G046150 Sobic003G433000--Sobic002G374000 Sobic003G433000--Sobic004G267400 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G433000--Sobic010G105900
Octagon: transcription factors


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