Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G374000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QFH1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G072201 - -
2 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
3 Sobic.004G315400 cation efflux family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G212900 FHA domain containing protein, putative, expressed K10867: NBN, nibrin
5 Sobic.001G383200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@bromodomain domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G127600 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
7 Sobic.007G183600 expressed protein -
8 Sobic.003G069601 - -
9 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
10 Sobic.002G187900 expressed protein -
11 Sobic.003G263900 reticulon domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G255200 - -
14 Sobic.005G031400 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G045601 - -
16 Sobic.001G442000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K14379: tartrate-resistant acid phosphatase type 5
17 Sobic.003G063400 glycosyltransferase family 43 protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G157450 - -
19 Sobic.007G075600 pectinesterase, putative, expressed -
20 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic002G374000--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic002G374000--Sobic001G109400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic002G374000--Sobic004G315400 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic002G374000--Sobic001G212900 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic002G374000--Sobic001G383200 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic002G374000--Sobic004G127600 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic002G374000--Sobic007G183600 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic002G374000--Sobic003G069601 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic002G374000--Sobic010G012200 Sobic004G072201--Sobic001G383200 Sobic004G072201--Sobic002G374000 Sobic004G072201--Sobic001G109400 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic002G309300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic004G072201--Sobic001G038700 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic004G072201--Sobic001G442000 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic004G072201--Sobic006G255200 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic004G072201--Sobic003G263900 Sobic004G072201--Sobic007G183600 Sobic001G109400--Sobic001G212900 Sobic001G109400--Sobic004G072201 Sobic001G109400--Sobic002G374000 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G109400--Sobic002G187900 Sobic001G109400--Sobic001G383200 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic001G109400--Sobic006G249600 Sobic001G109400--Sobic006G255200 Sobic001G109400--Sobic004G315400 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic001G109400--Sobic008G016800 Sobic004G315400--Sobic002G374000 Sobic004G315400--Sobic010G012200 Sobic004G315400--Sobic001G109400 Sobic004G315400--Sobic001G212900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic004G315400--Sobic008G103400 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic004G315400--Sobic001G483001 Sobic004G315400--Sobic004G072201 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic004G315400--Sobic005G031400 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic004G315400--Sobic002G110600 Sobic001G212900--Sobic001G109400 Sobic001G212900--Sobic006G249600 Sobic001G212900--Sobic002G187900 Sobic001G212900--Sobic002G374000 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic001G212900--Sobic010G000200 Sobic001G212900--Sobic002G110600 Sobic001G212900--Sobic004G127600 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G212900--Sobic004G173200 Sobic001G212900--Sobic010G012200 Sobic001G383200--Sobic004G072201 Sobic001G383200--Sobic001G109400 Sobic001G383200--Sobic002G374000 Sobic001G383200--Sobic002G309300 Sobic001G383200--Sobic003G263900 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G383200--Sobic006G157450 Sobic001G383200--Sobic001G038700 Sobic001G383200--Sobic008G103400 Sobic001G383200--Sobic006G255200 Sobic004G127600--Sobic002G187900 Sobic004G127600--Sobic003G263900 Sobic004G127600--Sobic006G255200 Sobic004G127600--Sobic001G442000 Sobic004G127600--Sobic001G212900 Sobic004G127600--Sobic001G109400 Sobic004G127600--Sobic002G374000 Sobic004G127600--Sobic004G072201 Sobic004G127600--Sobic001G038700 Sobic007G183600--Sobic003G069601 Sobic007G183600--Sobic004G072201 Sobic007G183600--Sobic002G374000 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic007G183600--Sobic004G093700 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic007G183600--Sobic004G068600 Sobic007G183600--Sobic001G383200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic007G183600--Sobic003G063400 Sobic007G183600--Sobic001G442000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic007G183600--Sobic009G026600 Sobic003G069601--Sobic007G183600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G069601--Sobic001G261452 Sobic003G069601--Sobic002G374000 Sobic003G069601--Sobic004G072201 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G069601--Sobic008G046700 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic003G069601--Sobic006G045601 Sobic003G069601--Sobic006G255200 Sobic003G069601--Sobic001G442000 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G069601--Sobic002G127300 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic010G012200--Sobic001G520000 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic010G012200--Sobic003G155000 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic001G038700 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic010G012200--Sobic008G170800 Sobic010G012200--Sobic006G157450 Sobic010G012200--Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic004G315400 Sobic010G012200--Sobic008G103400
Octagon: transcription factors


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