Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G433000.1
Synonym Sb03g046440
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5XIK4
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF168
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71250 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g02094.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G045800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G267650 - -
2 Sobic.003G069601 - -
3 Sobic.008G046700 nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G280250 - -
5 Sobic.001G174100 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
6 Sobic.002G046150 - -
7 Sobic.002G374000 - -
8 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
9 Sobic.010G105900 - -
10 Sobic.001G244650 - -
11 Sobic.004G231100 expressed protein -
12 Sobic.001G285100 expressed protein -
13 Sobic.001G187900 disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G261452 - -
15 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
17 Sobic.009G212500 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
18 Sobic.006G045601 - -
19 Sobic.010G229025 - -
20 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic004G267650 Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic004G267650 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic003G433000--Sobic003G069601 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G433000--Sobic008G046700 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic003G433000--Sobic006G280250 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic003G433000--Sobic001G174100 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic003G433000--Sobic002G046150 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic003G433000--Sobic002G374000 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic003G433000--Sobic004G267400 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G433000--Sobic010G105900 Sobic004G267650--Sobic001G174100 Sobic004G267650--Sobic008G046700 Sobic004G267650--Sobic003G433000 Sobic004G267650--Sobic002G046150 Sobic004G267650--Sobic003G069601 Sobic004G267650--Sobic006G280250 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic004G267650--Sobic010G089350 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G267650--Sobic007G149500 Sobic004G267650--Sobic004G267400 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic003G069601--Sobic007G183600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic003G069601--Sobic001G261452 Sobic003G069601--Sobic002G374000 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic003G069601--Sobic004G072201 Sobic003G069601--Sobic008G046700 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic003G069601--Sobic006G045601 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic003G069601--Sobic006G255200 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic003G069601--Sobic001G442000 Sobic002G127300 Sobic002G127300 Sobic003G069601--Sobic002G127300 Sobic008G046700--Sobic003G069601 Sobic008G046700--Sobic004G267650 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic008G046700--Sobic002G181500 Sobic008G046700--Sobic001G261452 Sobic008G046700--Sobic007G183600 Sobic008G046700--Sobic002G046150 Sobic008G046700--Sobic001G174100 Sobic008G046700--Sobic004G072201 Sobic008G046700--Sobic003G433000 Sobic008G075500 Sobic008G075500 Sobic006G280250--Sobic008G075500 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic006G280250--Sobic004G091300 Sobic009G212500 Sobic009G212500 Sobic006G280250--Sobic009G212500 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic006G280250--Sobic002G208900 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic006G280250--Sobic008G169500 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic006G280250--Sobic006G215650 Sobic006G280250--Sobic004G267650 Sobic003G057000 Sobic003G057000 Sobic006G280250--Sobic003G057000 Sobic006G280250--Sobic002G046150 Sobic005G168200 Sobic005G168200 Sobic001G174100--Sobic005G168200 Sobic002G375500 Sobic002G375500 Sobic001G174100--Sobic002G375500 Sobic001G174100--Sobic004G267650 Sobic007G175100 Sobic007G175100 Sobic001G174100--Sobic007G175100 Sobic007G038100 Sobic007G038100 Sobic001G174100--Sobic007G038100 Sobic001G174100--Sobic002G046150 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic001G174100--Sobic001G145550 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic001G174100--Sobic002G208500 Sobic001G174100--Sobic008G046700 Sobic002G046150--Sobic007G149500 Sobic002G046150--Sobic006G215650 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G046150--Sobic009G247200 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G046150--Sobic006G221500 Sobic002G086900 Sobic002G086900 Sobic002G046150--Sobic002G086900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic002G046150--Sobic003G230800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic002G046150--Sobic002G208700 Sobic002G046150--Sobic005G168200 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic002G046150--Sobic009G173700 Sobic002G374000--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic002G374000--Sobic001G109400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic002G374000--Sobic004G315400 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic002G374000--Sobic001G212900 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic002G374000--Sobic001G383200 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic002G374000--Sobic004G127600 Sobic002G374000--Sobic007G183600 Sobic002G374000--Sobic003G069601 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic002G374000--Sobic010G012200 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic004G267400--Sobic004G068600 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic004G267400--Sobic001G052700 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic004G267400--Sobic006G136300 Sobic004G267400--Sobic002G374000 Sobic004G267400--Sobic006G221500 Sobic004G267400--Sobic007G183600 Sobic004G267400--Sobic004G315400 Sobic004G267400--Sobic003G069601 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic004G267400--Sobic005G228650 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic010G105900--Sobic008G016800 Sobic010G105900--Sobic001G212900 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic010G105900--Sobic008G160100 Sobic010G105900--Sobic001G109400 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic010G105900--Sobic002G197400 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic010G105900--Sobic006G249600 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic010G105900--Sobic007G189900 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic010G105900--Sobic002G110600 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic010G105900--Sobic003G262500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.