Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G105900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIC8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G016800 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G212900 FHA domain containing protein, putative, expressed K10867: NBN, nibrin
3 Sobic.008G160100 - -
4 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
5 Sobic.002G197400 expressed protein -
6 Sobic.006G249600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@MBTB14 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
7 Sobic.007G189900 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G110600 regulatory protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G262500 OsPOP3 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
10 Sobic.001G191300 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
11 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
12 Sobic.002G374000 - -
13 Sobic.006G082100 dehydration-responsive element-binding protein, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
14 Sobic.004G257900 - -
15 Sobic.004G310400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
16 Sobic.001G096200 mitochondrial ribosomal protein S10, putative, expressed K02946: RP-S10, MRPS10, small subunit ribosomal protein S10
17 Sobic.006G213350 - -
18 Sobic.005G228650 - -
19 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic010G105900--Sobic008G016800 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic010G105900--Sobic001G212900 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic010G105900--Sobic008G160100 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic010G105900--Sobic001G109400 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic010G105900--Sobic002G197400 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic010G105900--Sobic006G249600 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic010G105900--Sobic007G189900 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic010G105900--Sobic002G110600 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic010G105900--Sobic003G262500 Sobic008G016800--Sobic002G110600 Sobic008G016800--Sobic001G109400 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic008G016800--Sobic008G103400 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic008G016800--Sobic002G398600 Sobic008G016800--Sobic001G212900 Sobic008G016800--Sobic006G249600 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic008G016800--Sobic003G362800 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic008G016800--Sobic001G383200 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic008G016800--Sobic001G191300 Sobic001G212900--Sobic001G109400 Sobic001G212900--Sobic006G249600 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G212900--Sobic002G187900 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic001G212900--Sobic002G374000 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic001G212900--Sobic010G000200 Sobic001G212900--Sobic002G110600 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic001G212900--Sobic004G127600 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic001G212900--Sobic004G173200 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G212900--Sobic010G012200 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic008G160100--Sobic001G520000 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic008G160100--Sobic001G483001 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic008G160100--Sobic006G213350 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic008G160100--Sobic005G228650 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic008G160100--Sobic004G026000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic008G160100--Sobic004G310400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic008G160100--Sobic004G315400 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic008G160100--Sobic008G143901 Sobic008G160100--Sobic010G012200 Sobic001G109400--Sobic001G212900 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G109400--Sobic004G072201 Sobic001G109400--Sobic002G374000 Sobic001G109400--Sobic002G187900 Sobic001G109400--Sobic001G383200 Sobic001G109400--Sobic006G249600 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G109400--Sobic006G255200 Sobic001G109400--Sobic004G315400 Sobic001G109400--Sobic008G016800 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic002G197400--Sobic004G091300 Sobic002G197400--Sobic008G160100 Sobic002G197400--Sobic002G110600 Sobic002G197400--Sobic008G016800 Sobic002G197400--Sobic004G310400 Sobic001G096200 Sobic001G096200 Sobic002G197400--Sobic001G096200 Sobic002G197400--Sobic004G026000 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic002G197400--Sobic002G399000 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic002G197400--Sobic003G118500 Sobic006G249600--Sobic001G212900 Sobic006G249600--Sobic002G398600 Sobic006G249600--Sobic002G187900 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G249600--Sobic003G253700 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic006G249600--Sobic003G155000 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic006G249600--Sobic003G263900 Sobic006G249600--Sobic001G109400 Sobic006G249600--Sobic004G173200 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic006G249600--Sobic006G157450 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic007G189900--Sobic002G387000 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic007G189900--Sobic001G312801 Sobic007G189900--Sobic010G105900 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic007G189900--Sobic009G181900 Sobic007G189900--Sobic004G310400 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic007G189900--Sobic004G257900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic007G189900--Sobic010G043700 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic007G189900--Sobic003G301950 Sobic007G189900--Sobic003G262500 Sobic002G110600--Sobic008G103400 Sobic002G110600--Sobic008G016800 Sobic002G110600--Sobic001G212900 Sobic002G110600--Sobic003G362800 Sobic002G110600--Sobic004G173200 Sobic002G110600--Sobic010G012200 Sobic002G110600--Sobic001G109400 Sobic002G110600--Sobic004G315400 Sobic002G110600--Sobic002G398600 Sobic006G082100 Sobic006G082100 Sobic003G262500--Sobic006G082100 Sobic003G262500--Sobic009G181900 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic003G262500--Sobic009G112500 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic003G262500--Sobic002G377400 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic003G262500--Sobic010G249600 Sobic003G262500--Sobic010G105900 Sobic003G262500--Sobic006G249600 Sobic003G262500--Sobic002G387000 Sobic003G262500--Sobic002G398600
Octagon: transcription factors


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