Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G189900.1
Synonym Sb07g025950
Functional annotation membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YHP6
Pfam PF04535
Panther DB PTHR11615 PTHR11615:SF120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06390 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g42430.1 : membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005307 , Zm00025a030453
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic007G189900--Sobic002G387000 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic007G189900--Sobic001G312801 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic007G189900--Sobic010G105900 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic007G189900--Sobic009G181900 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic007G189900--Sobic004G310400 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic007G189900--Sobic004G257900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic007G189900--Sobic010G043700 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic007G189900--Sobic003G301950 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic007G189900--Sobic003G262500 Sobic002G387000--Sobic007G189900 Sobic002G387000--Sobic001G312801 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic002G387000--Sobic010G118401 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic002G387000--Sobic009G112500 Sobic002G387000--Sobic003G301950 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic002G387000--Sobic001G490600 Sobic002G387000--Sobic009G181900 Sobic001G507700 Sobic001G507700 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Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic003G262500--Sobic002G398600
Octagon: transcription factors


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