Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G257900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YSR3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G197500 2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase domain containing protein, expressed K00627: DLAT, aceF, pyruvate dehydrogenase E2 component (dihydrolipoamide acetyltransferase)
2 Sobic.002G207601 - -
3 Sobic.001G156401 - -
4 Sobic.008G143901 - -
5 Sobic.006G213350 - -
6 Sobic.008G160100 - -
7 Sobic.004G310400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
8 Sobic.007G189900 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G096200 mitochondrial ribosomal protein S10, putative, expressed K02946: RP-S10, MRPS10, small subunit ribosomal protein S10
10 Sobic.004G026000 ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
11 Sobic.006G243000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCB4, putative, expressed -
12 Sobic.010G105900 - -
13 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
14 Sobic.001G139800 growth regulating factor protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G336300 C2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G494400 DUF593 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G312801 - -
18 Sobic.010G220100 cell cycle control protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G416900 esterase, putative, expressed -
20 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic004G257900--Sobic002G197500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic004G257900--Sobic002G207601 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic004G257900--Sobic001G156401 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic004G257900--Sobic008G143901 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic004G257900--Sobic006G213350 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic004G257900--Sobic008G160100 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic004G257900--Sobic004G310400 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic004G257900--Sobic007G189900 Sobic001G096200 Sobic001G096200 Sobic004G257900--Sobic001G096200 Sobic002G197500--Sobic004G257900 Sobic002G197500--Sobic002G207601 Sobic002G197500--Sobic001G156401 Sobic002G197500--Sobic007G189900 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic002G197500--Sobic003G336300 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic002G197500--Sobic010G105900 Sobic002G197500--Sobic006G213350 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic002G197500--Sobic001G494400 Sobic003G416900 Sobic003G416900 Sobic002G197500--Sobic003G416900 Sobic002G207601--Sobic004G257900 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G207601--Sobic001G489400 Sobic002G207601--Sobic006G213350 Sobic002G207601--Sobic002G197500 Sobic002G207601--Sobic001G156401 Sobic002G207601--Sobic008G143901 Sobic001G139800 Sobic001G139800 Sobic002G207601--Sobic001G139800 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G207601--Sobic009G199401 Sobic005G160500 Sobic005G160500 Sobic002G207601--Sobic005G160500 Sobic009G118700 Sobic009G118700 Sobic001G156401--Sobic009G118700 Sobic001G156401--Sobic001G494400 Sobic001G156401--Sobic008G143901 Sobic001G156401--Sobic004G257900 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic001G156401--Sobic006G243000 Sobic001G156401--Sobic001G139800 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic001G156401--Sobic002G413700 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic001G156401--Sobic002G395900 Sobic010G219700 Sobic010G219700 Sobic001G156401--Sobic010G219700 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic008G143901--Sobic001G483001 Sobic008G143901--Sobic006G243000 Sobic008G143901--Sobic006G213350 Sobic008G143901--Sobic002G413700 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic008G143901--Sobic001G520000 Sobic008G143901--Sobic008G160100 Sobic008G143901--Sobic001G139800 Sobic008G143901--Sobic001G096200 Sobic008G143901--Sobic001G156401 Sobic006G213350--Sobic001G520000 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic006G213350--Sobic005G031400 Sobic006G213350--Sobic001G483001 Sobic006G213350--Sobic008G160100 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic006G213350--Sobic010G012200 Sobic006G213350--Sobic008G143901 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G213350--Sobic003G253700 Sobic006G213350--Sobic006G243000 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic006G213350--Sobic006G157450 Sobic008G160100--Sobic001G520000 Sobic008G160100--Sobic001G483001 Sobic008G160100--Sobic006G213350 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic008G160100--Sobic005G228650 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic008G160100--Sobic004G026000 Sobic008G160100--Sobic004G310400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic008G160100--Sobic004G315400 Sobic008G160100--Sobic008G143901 Sobic008G160100--Sobic010G012200 Sobic004G310400--Sobic004G026000 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic004G310400--Sobic004G144300 Sobic004G310400--Sobic001G096200 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G310400--Sobic004G314100 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic004G310400--Sobic003G118500 Sobic001G104100 Sobic001G104100 Sobic004G310400--Sobic001G104100 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic004G310400--Sobic006G121200 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic004G310400--Sobic007G213500 Sobic004G310400--Sobic008G160100 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic007G189900--Sobic002G387000 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic007G189900--Sobic001G312801 Sobic007G189900--Sobic010G105900 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic007G189900--Sobic009G181900 Sobic007G189900--Sobic004G310400 Sobic007G189900--Sobic004G257900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic007G189900--Sobic010G043700 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic007G189900--Sobic003G301950 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic007G189900--Sobic003G262500 Sobic001G096200--Sobic004G310400 Sobic001G096200--Sobic004G026000 Sobic001G096200--Sobic001G520000 Sobic001G096200--Sobic004G314100 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic001G096200--Sobic003G155800 Sobic001G096200--Sobic006G243000 Sobic001G096200--Sobic003G118500 Sobic001G096200--Sobic003G253700 Sobic004G231501 Sobic004G231501 Sobic001G096200--Sobic004G231501
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.