Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G160100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PE20
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
2 Sobic.001G483001 - -
3 Sobic.006G213350 - -
4 Sobic.005G228650 - -
5 Sobic.004G026000 ankyrin repeat domain-containing protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
6 Sobic.004G310400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
7 Sobic.004G315400 cation efflux family protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G143901 - -
9 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
10 Sobic.001G096200 mitochondrial ribosomal protein S10, putative, expressed K02946: RP-S10, MRPS10, small subunit ribosomal protein S10
11 Sobic.002G110600 regulatory protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G197400 expressed protein -
13 Sobic.006G157450 - -
14 Sobic.003G362800 - -
15 Sobic.004G144300 - -
16 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
17 Sobic.001G212900 FHA domain containing protein, putative, expressed K10867: NBN, nibrin
18 Sobic.009G252600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
19 Sobic.008G016800 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2


Gene co-expression network
sample Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic008G160100--Sobic001G520000 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic008G160100--Sobic001G483001 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic008G160100--Sobic006G213350 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic008G160100--Sobic005G228650 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic008G160100--Sobic004G026000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic008G160100--Sobic004G310400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic008G160100--Sobic004G315400 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic008G160100--Sobic008G143901 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic008G160100--Sobic010G012200 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic001G520000--Sobic003G253700 Sobic001G520000--Sobic006G213350 Sobic001G520000--Sobic001G483001 Sobic001G520000--Sobic010G012200 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic001G520000--Sobic003G155000 Sobic001G520000--Sobic008G160100 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G520000--Sobic006G157450 Sobic001G096200 Sobic001G096200 Sobic001G520000--Sobic001G096200 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G520000--Sobic008G170800 Sobic001G483001--Sobic001G520000 Sobic001G483001--Sobic006G213350 Sobic001G483001--Sobic008G143901 Sobic001G483001--Sobic008G160100 Sobic001G483001--Sobic006G157450 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic008G170800 Sobic001G483001--Sobic010G012200 Sobic001G483001--Sobic003G253700 Sobic006G213350--Sobic001G520000 Sobic006G213350--Sobic005G031400 Sobic006G213350--Sobic001G483001 Sobic006G213350--Sobic008G160100 Sobic006G213350--Sobic010G012200 Sobic006G213350--Sobic008G143901 Sobic006G213350--Sobic003G253700 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic006G213350--Sobic006G243000 Sobic006G213350--Sobic006G157450 Sobic005G228650--Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic006G157450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic005G228650--Sobic001G245100 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic001G483001 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic005G228650--Sobic001G038700 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic005G228650--Sobic010G042300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic005G228650--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic005G228650--Sobic001G109400 Sobic004G026000--Sobic004G310400 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic004G026000--Sobic007G213500 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G026000--Sobic004G314100 Sobic001G104100 Sobic001G104100 Sobic004G026000--Sobic001G104100 Sobic004G026000--Sobic001G096200 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic004G026000--Sobic006G121200 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic004G026000--Sobic003G106100 Sobic004G231501 Sobic004G231501 Sobic004G026000--Sobic004G231501 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic004G026000--Sobic001G028500 Sobic004G310400--Sobic004G026000 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic004G310400--Sobic004G144300 Sobic004G310400--Sobic001G096200 Sobic004G310400--Sobic004G314100 Sobic003G118500 Sobic003G118500 Sobic004G310400--Sobic003G118500 Sobic004G310400--Sobic001G104100 Sobic004G310400--Sobic006G121200 Sobic004G310400--Sobic007G213500 Sobic004G310400--Sobic008G160100 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G315400--Sobic002G374000 Sobic004G315400--Sobic010G012200 Sobic004G315400--Sobic001G109400 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic004G315400--Sobic001G212900 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic004G315400--Sobic008G103400 Sobic004G315400--Sobic001G483001 Sobic004G315400--Sobic004G072201 Sobic004G315400--Sobic005G031400 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic004G315400--Sobic002G110600 Sobic008G143901--Sobic001G483001 Sobic008G143901--Sobic006G243000 Sobic008G143901--Sobic006G213350 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic008G143901--Sobic002G413700 Sobic008G143901--Sobic001G520000 Sobic008G143901--Sobic008G160100 Sobic001G139800 Sobic001G139800 Sobic008G143901--Sobic001G139800 Sobic008G143901--Sobic001G096200 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic008G143901--Sobic001G156401 Sobic010G012200--Sobic001G520000 Sobic010G012200--Sobic003G155000 Sobic010G012200--Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic001G038700 Sobic010G012200--Sobic008G170800 Sobic010G012200--Sobic006G157450 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic004G315400 Sobic010G012200--Sobic008G103400
Octagon: transcription factors


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