Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G228650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKK1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G160100 - -
2 Sobic.006G157450 - -
3 Sobic.001G245100 - -
4 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
5 Sobic.001G483001 - -
6 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
8 Sobic.004G072201 - -
9 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
10 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
11 Sobic.002G127300 - -
12 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
13 Sobic.004G315400 cation efflux family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G309300 beta-expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G383200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@bromodomain domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G001650 - -
17 Sobic.002G374000 - -
18 Sobic.010G000200 expressed protein -
19 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
20 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic008G160100 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic005G228650--Sobic006G157450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic005G228650--Sobic001G245100 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic006G279100 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic005G228650--Sobic001G483001 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic005G228650--Sobic001G038700 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic005G228650--Sobic010G042300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic005G228650--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic005G228650--Sobic001G109400 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic008G160100--Sobic001G520000 Sobic008G160100--Sobic001G483001 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic008G160100--Sobic006G213350 Sobic008G160100--Sobic005G228650 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic008G160100--Sobic004G026000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic008G160100--Sobic004G310400 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic008G160100--Sobic004G315400 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic008G160100--Sobic008G143901 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic008G160100--Sobic010G012200 Sobic006G157450--Sobic001G038700 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic006G157450--Sobic008G170800 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic006G157450--Sobic001G191500 Sobic006G157450--Sobic001G520000 Sobic006G157450--Sobic010G012200 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G157450--Sobic003G253700 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic006G157450--Sobic003G155000 Sobic006G157450--Sobic001G483001 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic006G157450--Sobic008G190600 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic001G245100--Sobic007G052000 Sobic001G245100--Sobic006G157450 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic001G245100--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic001G245100--Sobic004G237900 Sobic001G245100--Sobic005G228650 Sobic001G245100--Sobic008G190600 Sobic001G245100--Sobic006G213350 Sobic001G245100--Sobic008G170800 Sobic001G245100--Sobic001G483001 Sobic006G279100--Sobic010G042300 Sobic005G070951 Sobic005G070951 Sobic006G279100--Sobic005G070951 Sobic006G279100--Sobic001G483001 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G279100--Sobic001G090700 Sobic006G279100--Sobic008G170800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic006G279100--Sobic002G208700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic006G279100--Sobic001G460900 Sobic006G279100--Sobic005G228650 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic006G279100--Sobic001G150100 Sobic001G483001--Sobic001G520000 Sobic001G483001--Sobic006G213350 Sobic001G483001--Sobic008G143901 Sobic001G483001--Sobic008G160100 Sobic001G483001--Sobic006G157450 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic008G170800 Sobic001G483001--Sobic010G012200 Sobic001G483001--Sobic003G253700 Sobic001G038700--Sobic006G157450 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic001G038700--Sobic003G263900 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic001G038700--Sobic002G309300 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G038700--Sobic004G218400 Sobic001G038700--Sobic010G012200 Sobic001G038700--Sobic008G170800 Sobic001G038700--Sobic004G072201 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G038700--Sobic009G026600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic001G038700--Sobic008G142200 Sobic010G042300--Sobic006G279100 Sobic010G042300--Sobic001G090700 Sobic010G042300--Sobic008G170800 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic010G042300--Sobic008G103400 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic010G042300--Sobic003G001650 Sobic010G042300--Sobic002G208700 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic010G042300--Sobic001G383200 Sobic010G042300--Sobic004G072201 Sobic010G042300--Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic001G383200 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G072201--Sobic002G374000 Sobic004G072201--Sobic001G109400 Sobic004G072201--Sobic002G309300 Sobic004G072201--Sobic001G038700 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic004G072201--Sobic001G442000 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic004G072201--Sobic006G255200 Sobic004G072201--Sobic003G263900 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G072201--Sobic007G183600 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic001G109400--Sobic001G212900 Sobic001G109400--Sobic004G072201 Sobic001G109400--Sobic002G374000 Sobic002G187900 Sobic002G187900 Sobic001G109400--Sobic002G187900 Sobic001G109400--Sobic001G383200 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic001G109400--Sobic006G249600 Sobic001G109400--Sobic006G255200 Sobic001G109400--Sobic004G315400 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic001G109400--Sobic008G016800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.