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Transcriptome id Sobic.001G245100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QKR4
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G052000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
2 Sobic.006G157450 - -
3 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
4 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G228650 - -
6 Sobic.008G190600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oxidoreductase, putative, expressed K07007: 3-dehydro-bile acid Delta4,6-reductase
7 Sobic.006G213350 - -
8 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
9 Sobic.001G483001 - -
10 Sobic.005G031400 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G016200 expressed protein -
12 Sobic.001G038700 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G298000 - -
14 Sobic.001G191500 expressed protein -
15 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
16 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
17 Sobic.001G460900 expressed protein -
18 Sobic.008G142200 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.008G160100 - -
20 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic001G245100--Sobic007G052000 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G245100--Sobic006G157450 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic001G245100--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic001G245100--Sobic004G237900 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic001G245100--Sobic005G228650 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G245100--Sobic008G190600 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic001G245100--Sobic006G213350 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G245100--Sobic008G170800 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic001G245100--Sobic001G483001 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic007G052000--Sobic010G054150 Sobic007G052000--Sobic001G245100 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic007G052000--Sobic003G335000 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic009G186300 Sobic007G052000--Sobic008G170800 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic007G052000--Sobic002G309300 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic007G052000--Sobic006G248450 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic007G052000--Sobic008G142200 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G052000--Sobic001G191500 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic006G157450--Sobic001G038700 Sobic006G157450--Sobic008G170800 Sobic006G157450--Sobic001G191500 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic006G157450--Sobic001G520000 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic006G157450--Sobic010G012200 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic006G157450--Sobic003G253700 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic006G157450--Sobic003G155000 Sobic006G157450--Sobic001G483001 Sobic006G157450--Sobic008G190600 Sobic003G399800--Sobic004G237900 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic003G399800--Sobic004G258450 Sobic003G399800--Sobic001G245100 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic003G399800--Sobic009G049100 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic003G399800--Sobic002G107700 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic003G399800--Sobic004G070150 Sobic003G399800--Sobic007G052000 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic003G399800--Sobic003G298000 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic003G399800--Sobic003G336300 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic004G237900--Sobic001G385132 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic006G157450 Sobic005G228650--Sobic001G245100 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic001G483001 Sobic005G228650--Sobic001G038700 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic005G228650--Sobic010G042300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic005G228650--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic005G228650--Sobic001G109400 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic008G190600--Sobic009G074800 Sobic008G190600--Sobic001G191500 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic008G190600--Sobic005G031400 Sobic008G190600--Sobic008G142200 Sobic008G190600--Sobic008G170800 Sobic008G190600--Sobic006G157450 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic008G190600--Sobic003G219300 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic008G190600--Sobic001G460900 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic008G190600--Sobic002G226200 Sobic006G213350--Sobic001G520000 Sobic006G213350--Sobic005G031400 Sobic006G213350--Sobic001G483001 Sobic006G213350--Sobic008G160100 Sobic006G213350--Sobic010G012200 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic006G213350--Sobic008G143901 Sobic006G213350--Sobic003G253700 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic006G213350--Sobic006G243000 Sobic006G213350--Sobic006G157450 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic008G170800--Sobic001G090700 Sobic008G170800--Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic001G038700 Sobic008G170800--Sobic010G012200 Sobic008G170800--Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic003G155000 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic008G170800--Sobic001G454600 Sobic008G170800--Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic003G253700 Sobic001G483001--Sobic001G520000 Sobic001G483001--Sobic006G213350 Sobic001G483001--Sobic008G143901 Sobic001G483001--Sobic008G160100 Sobic001G483001--Sobic006G157450 Sobic001G483001--Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic008G170800 Sobic001G483001--Sobic010G012200 Sobic001G483001--Sobic003G253700
Octagon: transcription factors


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